Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2776212	2776243	32	38 [0]	[0] 68	arpA	regulator of acetyl CoA synthetase

ACATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAAT  >  minE/2776244‑2776304 |                                                             aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTatat  <  1:932499/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:611940/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:740529/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:718679/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:703194/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:680218/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:640901/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:6383/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:627907/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:619093/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:751877/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:611636/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:598164/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:588417/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:540807/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:539235/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:528367/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:1028930/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:506806/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:761623/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:77950/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:783110/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:783777/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:804125/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:806545/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:819315/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:838510/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:865059/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:87395/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:903823/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:943024/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:963108/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:985792/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:994494/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:244569/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:1029986/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:113640/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:127593/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:163343/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:167876/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:186684/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:187137/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:195732/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:202525/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:21019/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:212731/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:216952/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:231445/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:241905/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:493065/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:281563/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:442662/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:398531/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:386065/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:368988/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:366381/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:365416/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:363837/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:363056/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:361368/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:341988/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:317606/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:30445/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:29388/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:28709/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:250341/61‑1 (MQ=255) aCATGGCTGGACGGTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:240688/61‑1 (MQ=255) aCATAGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAat  <  1:838920/61‑1 (MQ=255) |                                                             ACATGGCTGGACGTTCTATTTTTGGCACTCAGGAATTTATACACTTGTTCGTTATCTAAAT  >  minE/2776244‑2776304

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑