Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2776765	2776970	206	26 [0]	[0] 92	arpA	regulator of acetyl CoA synthetase

ATATGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATG  >  minE/2776971‑2777021 |                                                   atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:750246/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:806721/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:798753/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:797383/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:788237/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:786038/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:779446/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:770722/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:768645/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:764254/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:753494/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:750376/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:807722/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:74973/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:736402/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:726415/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:710278/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:70144/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:694510/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:687403/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:682962/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:682798/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:67112/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:903258/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:997337/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:996227/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:995067/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:992027/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:96595/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:964781/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:956777/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:949323/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:935910/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:917311/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:907166/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:666020/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:895174/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:875514/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:864605/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:863019/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:836079/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:831901/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:827392/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:827232/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:819021/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:809688/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:202446/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:328417/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:320451/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:316281/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:290616/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:286332/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:272653/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:271617/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:25027/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:236762/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:221765/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:213469/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:34782/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:186485/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:180546/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:154989/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:151545/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:146265/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:14574/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:131143/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:127209/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:105974/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:1026234/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:417875/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:621436/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:609896/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:591644/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:578000/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:573640/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:555824/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:528362/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:507479/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:502650/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:49184/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:475236/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:1000306/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:416046/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:412512/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:412380/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:39933/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:39072/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:382452/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:377173/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:370210/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:369369/51‑1 (MQ=255) atatGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATg  <  1:367201/51‑1 (MQ=255) |                                                   ATATGGCTGCCATAACACTGATGCCATTTGATTCCATCTTGTCAAAATATG  >  minE/2776971‑2777021

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑