Missing coverage evidence...
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TAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGTG  >  minE/2795620‑2795681 |                                                              tAGCGGTATTGTTGTCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCcgc     >  1:97542/1‑59 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCggctggct                           >  1:174221/1‑37 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCcgcg    >  1:461193/1‑60 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:893130/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:612978/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:616041/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:642659/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:705226/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:71438/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:740044/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:833671/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:122427/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:909060/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:921941/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:949288/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:989368/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:990344/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:1012429/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:439995/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:411259/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:142498/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:407450/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:389838/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:374834/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:374028/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:511847/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:174108/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:357746/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:352989/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:295688/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:262400/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGtg  >  1:187024/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGt   >  1:748673/1‑61 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGt   >  1:752774/1‑61 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACACGATTACCCGCGtg  >  1:618771/1‑62 (MQ=255) tAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCAGCTGGCTGGa                        >  1:525881/1‑40 (MQ=255) |                                                              TAGCGGTATTGTTGGCGGTGGTCATCGCCTGCTGGCTGGATGTGGACGCGATTACCCGCGTG  >  minE/2795620‑2795681

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑