Missing coverage evidence...
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CCTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCTT  >  minE/2802038‑2802098 |                                                             ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACtat                 >  1:706340/1‑46 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:749569/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:519834/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:533778/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:580745/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:606049/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:630006/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:680351/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:725719/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:730226/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:733652/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:736542/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:48754/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:762912/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:788660/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:817804/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:823805/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:857157/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:869902/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:93474/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:949768/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:965602/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:994543/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:364623/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:1034551/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:10811/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:141204/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:167986/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:17733/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:277212/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:278972/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:287245/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:342365/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:364278/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:1018825/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:37049/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:396201/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:409451/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:410099/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:421073/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:429709/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:458402/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:464890/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:468184/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:476818/1‑61 (MQ=255) ccTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCAGAACTATAAAAAGAAAGGGCtt  >  1:351766/1‑61 (MQ=255) |                                                             CCTCTAACAGATTCATCGTGCTGTACCCTACATACAGCCGAACTATAAAAAGAAAGGGCTT  >  minE/2802038‑2802098

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑