Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	258000	258249	250	27 [0]	[0] 84	secF	SecYEG protein translocase auxillary subunit

CATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAG  >  minE/258247‑258308    |                                                           atcgACTTCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:472045/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCTTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:382135/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAAGCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:64698/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:531366/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:736930/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:729688/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:693311/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:690561/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:655274/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:619402/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:595368/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:57238/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:532631/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:755134/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:523072/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:495965/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:490875/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:48824/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:470833/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:434541/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:414151/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:891334/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:985618/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:983010/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:955984/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:955926/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:95072/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:9466/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:939449/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:908238/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:90322/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:89461/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:411224/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:85144/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:850606/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:846994/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:829965/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:793433/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:791808/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:785775/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:784541/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:768041/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:13701/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:1004182/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:193544/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:18214/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:179370/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:17527/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:170637/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:169155/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:168617/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:164171/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:156300/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:201972/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:125555/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:124009/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:118830/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:115691/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:110880/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:110860/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:1026643/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:1022258/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:1014705/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:343785/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:404755/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:391350/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:378280/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:377642/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:356826/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:356783/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:348515/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:221876/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:317380/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:316458/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:299126/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:290121/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:278072/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:261215/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:250587/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:246739/59‑1 (MQ=255) atcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:226775/59‑1 (MQ=255)  tcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:499064/59‑1 (MQ=255)  tcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:372335/59‑1 (MQ=255)  tcgACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAg  <  1:107703/59‑1 (MQ=255)    |                                                           CATGACATCATGGTCCGTATGCCGCCTGCTGAAGGCGAAACCGGCGGTCAGGTGTTGGGCAG  >  minE/258247‑258308

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑