Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2836611	2836728	118	45 [0]	[0] 51	yjeK	predicted lysine aminomutase

CAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTTGT  >  minE/2836729‑2836780 |                                                    cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGTATGGCTTCCAGTtgt  <  1:152168/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:811506/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:506991/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:520188/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:531538/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:54483/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:556729/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:557667/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:608077/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:644424/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:772294/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:778169/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:78788/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:804619/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:412636/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:846425/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:865180/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:883148/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:887001/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:89016/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:898422/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:912378/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:94505/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:945918/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:97818/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:986657/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:314483/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:1009528/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:106989/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:109942/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:124425/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:163130/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:211259/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:225383/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:231153/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:266588/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:268850/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:285891/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:307100/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:491527/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:318848/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:352195/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:362714/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:381133/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:382061/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:389118/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:396610/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:399070/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:4027/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:410173/52‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTtgt  <  1:1008969/52‑1 (MQ=255) |                                                    CAGACGGCTGTGAATCCGCAGACGTTTTATATGCGGGATGGCTTCCAGTTGT  >  minE/2836729‑2836780

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑