Missing coverage evidence...
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GGCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCGG  >  minE/2860801‑2860862 |                                                              ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTtg                 >  1:1015307/1‑47 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:731616/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:543784/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:547646/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:555353/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:576617/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:581841/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:615891/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:619690/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:628476/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:651862/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:526740/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:749828/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:751368/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:759881/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:858369/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:873234/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:916331/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:930593/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:947458/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:980193/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:993966/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:302414/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:134114/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:161414/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:181140/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:189188/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:19273/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:24596/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:261878/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:271668/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:274917/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:52079/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:334691/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:37797/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:39246/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:403554/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:428321/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:451269/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:46651/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:493201/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCAGCCgg  >  1:450097/1‑62 (MQ=255) ggCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGGTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCgg  >  1:841195/1‑62 (MQ=255) |                                                              GGCCATAACCCTGCTGGCGGACGTGGAACGGTTATGTCCGCAACTTGTGAAAACGCCGCCGG  >  minE/2860801‑2860862

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑