Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,652,895	0	G	C	47.6%	‑6.0 / 15.6	21	intergenic (‑49/+37)	uraA/upp	uracil transporter/uracil phosphoribosyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/11);  new base C (0/10);  total (0/21)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00
Rejected as consensus: E-value score below prediction cutoff.
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold.

ATGTGTTATAGGCGCTTTACTCAAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTATTTT  >  minE/1652865‑1652925                               |                               atGTGTTATAGGCGCTTTACTCAAAAAAAACCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:332801/61‑1 (MQ=255)              gcTTTACTCAAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:967717/48‑1 (MQ=255)              gcTTTACTCAAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:625846/48‑1 (MQ=255)              gcTTTACTCAAAAAAAACCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:853057/48‑1 (MQ=255)                tttACTCAAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:597137/46‑1 (MQ=255)                    cTCAAAAAAACGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:454712/42‑1 (MQ=255)                      cAAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:301925/40‑1 (MQ=255)                      cAAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:435018/40‑1 (MQ=255)                      cAAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:815620/40‑1 (MQ=255)                      cAAAAAAAACCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:437737/40‑1 (MQ=255)                      cAAAAAAAACCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:637131/40‑1 (MQ=255)                      cAAAAAAAACCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:723219/40‑1 (MQ=255)                       aaaaaaacGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:999334/39‑1 (MQ=255)                       aaaaaaacGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:259269/39‑1 (MQ=255)                       aaaaaaacCCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:720487/39‑1 (MQ=37)                       aaaaaaacCCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:700263/39‑1 (MQ=37)                       aaaaaaaaGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:382096/39‑1 (MQ=255)                       aaaaaaaaCCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:478766/39‑1 (MQ=255)                         aaaaacCCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:857396/37‑1 (MQ=37)                          aaaaaGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:898437/36‑1 (MQ=255)                          aaaaaCCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTAtttt  <  1:234082/36‑1 (MQ=255)                               |                               ATGTGTTATAGGCGCTTTACTCAAAAAAAAGCCGACTCTTAAAGTCGGCTTTAATTATTTT  >  minE/1652865‑1652925

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑