Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	2,444,662	C→T	Q158Q (CAG→CAA)	ilvD ←	dihydroxyacid dehydratase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	2,444,662	0	C	T	100.0%	126.8 / NA	38	Q158Q (CAG→CAA)	ilvD	dihydroxyacid dehydratase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (38/0);  total (38/0)

GATCGAGCTTGATGATCTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGA  >  minE/2444646‑2444706                 |                                             gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTcc                >  1:313881/1‑47 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCgg   >  1:367518/1‑60 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:68017/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:519688/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:557054/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:590490/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:642730/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:649604/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:6513/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:670566/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:413402/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:715820/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:805843/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:814728/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:872427/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:905991/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:934201/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:946080/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:959026/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:968617/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:312025/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:104928/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:126726/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:13522/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:218899/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:226955/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:259133/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:261846/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:435776/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:312987/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:318389/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:337158/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:340267/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:341258/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:403978/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:409933/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:1027778/1‑61 (MQ=255) gATCGAGCTTGATGATTTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCAGGCCTCCATCGGGCCGCCGGa  >  1:115409/1‑61 (MQ=255)                 |                                             GATCGAGCTTGATGATCTGATCGGAAAGTTTGGTTTTCCCGGCCTCCATCGGGCCGCCGGA  >  minE/2444646‑2444706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑