Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 85,601 G→A G33S (GGC→AGC)  murC → UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanine ligase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE85,6010GA100.0% 391.8 / NA 112G33S (GGC→AGC) murCUDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanine ligase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/112);  total (0/112)

Only 100 of 112 total aligned reads displayed.

CATTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAGG  >  minE/85571‑85632
                              |                               
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                   gtgCCGGTATGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:651259/43‑1 (MQ=255)
                           aTGAGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAgg  <  1:102752/35‑1 (MQ=255)
                              |                               
CATTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAGG  >  minE/85571‑85632

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑