| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 204740 | NA (NA) | 8 (0.200) | 5/104 | 3.1 | NA | noncoding (157/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | minE | = 204751 | NA (NA) | noncoding (168/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/204663‑204740‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < minE/204751‑204684 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1593828/71‑1GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:955508/71‑1GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1639940/71‑1 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1132595/69‑1 AAGGTGATATGATCCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:663672/1‑71 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:1215894/1‑71 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1673129/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2179429/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2284385/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:50275/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:1537812/1‑70 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:616534/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:1212464/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:2202847/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:2041513/71‑1 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:642527/71‑1 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:1111742/71‑1 TGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:963512/1‑67 TGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCAAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:664418/1‑68 ATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:704221/67‑1 ATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:681092/64‑1 TATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:2054223/1‑64 ATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGCCCCACTATCATTAACCgaa > 1:2165232/1‑68 ATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1568160/64‑1 AACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAat < 1:637524/61‑3 AACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:2423754/59‑1 CCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:794760/59‑1 GTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACGATCATT < 1:2575/57‑1 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA > 1:1638393/1‑55 TAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:1671743/1‑51 AACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:509256/52‑1 AACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:1643356/1‑50 GGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:1157341/1‑51 GCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA > 1:1046818/1‑69 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1447007/42‑1 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:1461555/1‑41 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:488793/39‑1 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:318305/39‑1 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:2418950/39‑1 CCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:789156/1‑42 GAATGGGGAAACCCAGTGTGATTCGACACACTATCATT < 1:507646/38‑1 AATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC < 1:314326/40‑1 AATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC < 1:2026493/40‑1 AATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC < 1:1372237/40‑1 AATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2413353/37‑1 GGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:1013035/35‑1 ACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA > 1:1085883/1‑50 ACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA > 1:255996/1‑50 ACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGA > 1:95648/1‑50 CAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGT < 1:57556/41‑1 GTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTA > 1:1212599/1‑41 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAc > 1:878370/1‑39 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:1265008/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:384606/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:2168206/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTT < 1:1430380/51‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTT < 1:680365/51‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:483288/1‑44 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:172218/1‑44 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCG < 1:2256989/37‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCG < 1:1501261/37‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCG < 1:550037/37‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCG < 1:2177019/37‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCG < 1:2089515/37‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGATACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:765091/1‑70 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:881462/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:752926/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:2025811/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:209016/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:566744/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:2033894/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:893076/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:1376425/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:1599827/1‑71 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAA > 1:1062448/1‑38 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAA > 1:1385194/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1672501/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:822933/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATT < 1:472926/57‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTC < 1:646396/51‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:169189/1‑38 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACCCACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1625104/1‑70 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTT < 1:1110556/71‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1566996/1‑70 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG > 1:949314/1‑69 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGG < 1:1320275/69‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCA < 1:1396460/54‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCA < 1:2245267/54‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGT < 1:910278/47‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC < 1:201233/42‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAA < 1:1298531/36‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:435144/35‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATC > 1:1172867/1‑63 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGG > 1:2347408/1‑44 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:1281570/1‑36 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTC > 1:479224/1‑55 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCAT < 1:1438101/53‑1 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCA > 1:156191/1‑52 ACCTATGTATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTG < 1:1546979/41‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTAGGAAATCGCCGGTTAT < 1:1311530/70‑1 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/204663‑204740‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < minE/204751‑204684 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |