| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 204058 = | NA (NA) | 4 (0.060) | 3/92 | NT | NA | noncoding (1463/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| ? | minE | 204096 = | NA (NA) | noncoding (1501/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA | |||||
GGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < minE/204131‑204058‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtaaCAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCT > minE/204096‑204164 GGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGG > 1:3572393/1‑71 GTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT < 1:97191/71‑1 GTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT < 1:634691/71‑1 GTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT < 1:3535785/71‑1 GTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT < 1:337813/71‑1 GTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT < 1:3165149/71‑1 GTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT < 1:2602672/71‑1 GTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT < 1:1978527/71‑1 TGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTA < 1:2310386/71‑1 TGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT > 1:3050968/1‑70 TGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT > 1:1813112/1‑70 GATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT > 1:1062084/1‑69 GATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT > 1:794195/1‑69 GATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT > 1:4406509/1‑69 GATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT > 1:3042129/1‑69 TCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAA < 1:244509/69‑1 CCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGT < 1:196262/66‑1 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTA < 1:203577/65‑1 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTA < 1:1358668/65‑1 TACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACATAGTGGT < 1:409624/49‑1 TTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAA > 1:2143476/1‑46 TTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAA > 1:2285458/1‑46 CCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGG < 1:681748/40‑1 CCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGG < 1:3581110/40‑1 CCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGG < 1:3452920/40‑1 CTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTA > 1:4151645/1‑41 CTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTA > 1:3239572/1‑41 TTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTA < 1:1703579/37‑1 TTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTA < 1:3838752/37‑1 TACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCA > 1:1599104/1‑71 CTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCC > 1:653130/1‑71 CTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCC > 1:3943962/1‑71 TGAATCACAAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTT < 1:1150267/59‑1 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTG > 1:3144022/1‑71 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTG > 1:2321941/1‑71 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTG > 1:4332009/1‑71 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTG > 1:3746250/1‑71 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGT < 1:239223/70‑1 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGT < 1:2432612/70‑1 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGT < 1:1469477/70‑1 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGT > 1:3801471/1‑70 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGT < 1:3784352/70‑1 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAA > 1:3098915/1‑56 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAA > 1:3097616/1‑56 GTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGAT > 1:372321/1‑36 GTAACAAGGGGACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTT < 1:1014840/64‑1 aAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGAT < 1:1703478/34‑1 TAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTA > 1:720353/1‑45 AACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTA < 1:1289039/49‑1 AACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCC > 1:2763844/1‑41 AACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCC > 1:2633667/1‑41 AACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCC > 1:2332759/1‑41 AACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCC > 1:713505/1‑41 AACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCAC < 1:2297083/37‑1 ACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCT > 1:2850021/1‑70 ACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCT > 1:918101/1‑70 ACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCT < 1:812481/70‑1 ACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCT > 1:1211450/1‑70 ACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCT < 1:2039309/70‑1 ACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTG < 1:1148541/63‑1 ACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACATTGCAGTGCT > 1:4362980/1‑70 GGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < minE/204131‑204058‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtaaCAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCT > minE/204096‑204164 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |