| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 204740 | NA (NA) | 17 (0.190) | 5/82 | NT | NA | noncoding (157/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | minE | = 204751 | NA (NA) | noncoding (168/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/204663‑204740‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATA < minE/204751‑204683 GGTAAGGTGATATGTACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:5867933/71‑1GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:6568961/71‑1GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:4804979/1‑71GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1599565/71‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:3891683/1‑70 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:1046029/1‑71 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:6454443/71‑1 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:2407180/71‑1 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:6605168/1‑71 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:4031692/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:6863140/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:4709789/1‑70 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:1162911/1‑70 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:3513041/71‑1 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:5800905/71‑1 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:372853/71‑1 TGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:2586869/1‑71 TGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:1915937/70‑1 GATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:1387578/69‑1 TGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:1329930/60‑1 CCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:5705030/55‑1 CCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1994008/55‑1 CCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:5335456/55‑1 CGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:718077/54‑1 CGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:6390013/1‑54 CGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:4644251/1‑54 TTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:2809042/52‑1 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGT > 1:5942084/1‑70 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:6369359/1‑57 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:6303705/1‑53 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:2418671/1‑53 ATAACCGGAGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:5066067/1‑57 TAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:5055298/53‑1 AACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:3480480/1‑55 AACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:5201839/1‑50 ACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:3148526/1‑53 ACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:5463600/1‑53 ATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1537425/44‑1 ATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT < 1:2643684/43‑1 ATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT < 1:756902/43‑1 ATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT < 1:5003973/43‑1 TTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:4654841/43‑1 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA > 1:2074197/1‑43 TTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1482549/42‑1 CCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:1463875/1‑42 TGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:871624/35‑1 ACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAAT > 1:1956124/1‑48 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:1101866/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCC > 1:6933545/1‑70 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGC > 1:1420896/1‑69 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTT < 1:5972570/52‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTT < 1:6265907/52‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTT < 1:563284/52‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:5533955/46‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:308299/42‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:4392980/42‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:2285236/42‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:57413/42‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC < 1:3787680/41‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC < 1:844154/41‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:5060598/38‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:4462764/38‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:3631780/38‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:4573567/38‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:3850843/38‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:2722904/38‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:944895/41‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:6425236/41‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:2753295/41‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:674842/1‑41 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:4143646/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:6908168/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:4741202/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:3399341/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTT > 1:411665/1‑50 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTT > 1:5225514/1‑50 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTT < 1:3007082/50‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA > 1:1710186/1‑36 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA > 1:3226024/1‑36 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA > 1:3308531/1‑36 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:3531564/1‑70 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC < 1:6200768/38‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:4609895/1‑71 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1220931/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1746269/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:4223057/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAA < 1:1829986/60‑1 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:4876963/1‑40 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:3439762/1‑40 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:3485878/1‑39 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:1022711/1‑39 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:3386548/1‑35 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2870019/1‑35 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:6516786/1‑35 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:6073195/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:2526110/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:140021/70‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCA < 1:2225721/51‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCA < 1:4009540/51‑1 CCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGC > 1:2915215/1‑62 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > minE/204663‑204740‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATA < minE/204751‑204683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |