| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 436259 = | 83 (0.780) | 76 (0.780) | 35/90 | NT | 57.1% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | = 2706018 | 38 (0.390) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
AGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATT > minE/436190‑436329 | tttttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTc < 1:6661590/71‑1 (MQ=255) tttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTc > 1:5882617/1‑69 (MQ=255) tttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAg > 1:2121309/1‑71 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc < 1:4333405‑M1/4‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg > 1:2636812‑M1/66‑71 (MQ=255) taaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:6120925‑M1/64‑67 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:4995765‑M1/62‑71 (MQ=255) aaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:3243026‑M1/61‑70 (MQ=255) aaGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:516659/1‑70 (MQ=255) aGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:768554/1‑69 (MQ=255) gCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGacac > 1:1006180/1‑71 (MQ=255) cAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactg < 1:3488850/71‑1 (MQ=255) cAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactg < 1:6944004/71‑1 (MQ=255) gacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactg < 1:72754‑M1/17‑1 (MQ=255) aGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgc < 1:6137474/71‑1 (MQ=255) tgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:1364839‑M1/47‑50 (MQ=255) tgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:166126‑M1/47‑50 (MQ=255) aCGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt < 1:2173963/71‑1 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgctaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTa > 1:1965606‑M1/45‑71 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg < 1:2728661‑M1/6‑1 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt < 1:511806‑M1/25‑1 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt < 1:253113‑M1/25‑1 (MQ=255) aTCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgc < 1:61087/59‑1 (MQ=255) aTCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa < 1:2587766/65‑1 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTaa > 1:5362284‑M1/40‑67 (MQ=255) cGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg > 1:6485061/1‑70 (MQ=255) cGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg > 1:2891035/1‑70 (MQ=255) tgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa < 1:5318687‑M1/12‑1 (MQ=255) tgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa < 1:1587635‑M1/12‑1 (MQ=255) gCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTaa > 1:4501047/1‑47 (MQ=255) gCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa < 1:5134838/71‑1 (MQ=255) cTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaa < 1:5557402/71‑1 (MQ=255) tacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataAATCAGCAAAGAcactgcact < 1:3840168‑M1/21‑1 (MQ=255) acaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAg < 1:2965244‑M1/29‑1 (MQ=255) acaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAg < 1:4093059‑M1/29‑1 (MQ=255) gggATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa > 1:6631123/1‑55 (MQ=255) ggATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt < 1:5234444/71‑1 (MQ=255) caggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg < 1:5894958‑M1/42‑1 (MQ=255) aTTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:574905/1‑70 (MQ=255) ttATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa < 1:6454629/69‑1 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa < 1:2052613/37‑1 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt < 1:3591817‑M1/46‑1 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt < 1:945736‑M1/46‑1 (MQ=255) aTTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:2223321/1‑36 (MQ=255) ttCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:6312267/1‑70 (MQ=255) ttCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg < 1:1103305/71‑1 (MQ=255) ttCATATACTACTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:593819/1‑70 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa < 1:2317878‑M1/39‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa < 1:1146101‑M1/39‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:560290‑M1/50‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:1339383‑M1/50‑1 (MQ=255) tttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa > 1:1704984‑M1/20‑62 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgca < 1:567822‑M1/19‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa > 1:1024982‑M1/19‑61 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:4900030‑M1/53‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:6717418‑M1/53‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:4379417‑M1/53‑1 (MQ=255) ataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGa < 1:4849614/51‑1 (MQ=255) ataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat > 1:6526091/1‑71 (MQ=255) ataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatga > 1:6165287/1‑70 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:3747303‑M1/53‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaa > 1:2859401/1‑52 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 1:623015/1‑51 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:6744964/71‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:5561382/71‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat > 1:30706/1‑70 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat > 1:3219924/1‑70 (MQ=255) cccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:19025‑M1/15‑64 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa < 1:3392031‑M1/24‑1 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa < 1:4070547‑M1/24‑1 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc > 1:471746‑M1/13‑71 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg > 1:4003448/1‑57 (MQ=255) gcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg > 1:5337367‑M1/12‑43 (MQ=255) gcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg > 1:6020653‑M1/12‑43 (MQ=255) gcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:1487615‑M1/12‑53 (MQ=255) cgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:598914‑M1/11‑71 (MQ=255) taaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaa > 1:36055‑M1/10‑44 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaa > 1:5358597‑M1/10‑44 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:2403468/1‑70 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAg < 1:1819900‑M1/29‑1 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAg < 1:2671394‑M1/29‑1 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa < 1:6574022‑M1/61‑1 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa < 1:1237740‑M1/61‑1 (MQ=255) gACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatga > 1:6852977/1‑59 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAg < 1:5390379‑M1/64‑1 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCt > 1:785571‑M1/6‑71 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:1995098‑M1/5‑71 (MQ=255) aataATTCAGCTAACACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:1112062‑M1/5‑71 (MQ=255) ataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:6083235‑M1/4‑57 (MQ=255) ataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta < 1:2442829‑M1/67‑1 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:1565763‑M1/3‑39 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:4343726‑M1/3‑39 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:4443970‑M1/3‑56 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:617808‑M1/50‑1 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:2806393‑M1/50‑1 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:3160117/1‑39 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat > 1:4249999/1‑70 (MQ=255) tATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:371606/54‑1 (MQ=255) tATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:4193655/54‑1 (MQ=255) tATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:730349/54‑1 (MQ=255) | AGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATT > minE/436190‑436329 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |