| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 13,583 | T→G | 6.6% | V474G (GTT→GGT) | dnaK → | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 13,583 | 0 | T | G | 6.6% | 415.1 / 22.0 | 151 | V474G (GTT→GGT) | dnaK | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (69/72); new base G (8/2); total (77/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.84e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
ACAAATCTCTGGGTCAGTTCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTAAAGAGCAG > minE/13514‑13653 | aCAAATCTCTGGGTCAGTTCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGt < 1:141291/70‑1 (MQ=255) aaaTCTCTGGGTCAGTTCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTAc > 1:1603674/1‑71 (MQ=255) aTCTCTGGGTCAGTTCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCt > 1:2977479/1‑71 (MQ=255) gggTCAGTTCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGata > 1:6261313/1‑71 (MQ=255) gTCAGTTCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATc < 1:4324541/71‑1 (MQ=255) tCAGTTCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATc > 1:357250/1‑70 (MQ=255) gTTCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATg < 1:3606120/71‑1 (MQ=255) gTTCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATg < 1:5629640/71‑1 (MQ=255) tCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATc > 1:855763/1‑65 (MQ=255) tCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCAAGCCGCAGATCGAAGTTAcca > 1:1937802/1‑56 (MQ=255) cAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGata > 1:447446/1‑62 (MQ=255) cAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATg > 1:2522621/1‑68 (MQ=255) cAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCt > 1:5902923/1‑70 (MQ=255) cAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCt > 1:5186079/1‑70 (MQ=255) ccTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATc < 1:2908979/61‑1 (MQ=255) ccTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACg > 1:6614363/1‑71 (MQ=255) aTGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATc < 1:4802027/56‑1 (MQ=255) aTGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATc < 1:4503383/56‑1 (MQ=255) aTGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATc < 1:5430815/56‑1 (MQ=255) aTGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATc < 1:166964/56‑1 (MQ=255) tGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATcc > 1:6568638/1‑71 (MQ=255) ggTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGt > 1:3801897/1‑41 (MQ=255) ggTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGa > 1:2265025/1‑56 (MQ=255) ggTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGa > 1:2500743/1‑56 (MQ=255) ggTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATg < 1:2033667/58‑1 (MQ=255) ggTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATg < 1:5559418/58‑1 (MQ=255) ggTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATg < 1:1805074/58‑1 (MQ=255) ggTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATg < 1:4185801/58‑1 (MQ=255) aTCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGa > 1:5636874/1‑47 (MQ=255) aTCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGa > 1:1241767/1‑47 (MQ=255) aTCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGa > 1:603605/1‑47 (MQ=255) aTCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGa > 1:527144/1‑47 (MQ=255) aTCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGa > 1:1685520/1‑47 (MQ=255) tCAACCCGTCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCAc < 1:170479/71‑1 (MQ=255) tCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCa < 1:6876650/70‑1 (MQ=255) tCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCAc < 1:3016907/71‑1 (MQ=255) tCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCAc > 1:1825752/1‑71 (MQ=255) tCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCAc < 1:597100/71‑1 (MQ=255) cccGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGttt < 1:22488/71‑1 (MQ=255) cccGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGttt < 1:357776/71‑1 (MQ=255) cccGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGttt > 1:5999024/1‑71 (MQ=255) ccGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTc < 1:1931801/71‑1 (MQ=255) cgcgGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGa > 1:775265/1‑67 (MQ=255) cgcgGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGa > 1:6926914/1‑67 (MQ=255) gcgGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGa > 1:6727518/1‑70 (MQ=255) cgGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATa < 1:3690011/71‑1 (MQ=255) cgGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATa < 1:6794176/71‑1 (MQ=255) ggCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGa > 1:2598092/1‑41 (MQ=255) ggCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGa > 1:4993896/1‑41 (MQ=255) cATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGt < 1:6820599/43‑1 (MQ=255) cATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGt < 1:5059197/43‑1 (MQ=255) cATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGaa < 1:3073577/63‑1 (MQ=255) cATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGaa < 1:6701886/63‑1 (MQ=255) cATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATaaa > 1:1712572/1‑70 (MQ=255) cATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATaaa > 1:6206015/1‑70 (MQ=255) cATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATaaa > 1:6089841/1‑70 (MQ=255) aTGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATaaa < 1:2637055/69‑1 (MQ=255) tGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCTAAAGATaaaaa > 1:2704660/1‑70 (MQ=255) tGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATaaaaa > 1:1107382/1‑70 (MQ=255) tGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAAc < 1:4166689/71‑1 (MQ=255) tGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAAc < 1:72073/71‑1 (MQ=255) tGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAAc < 1:467937/71‑1 (MQ=255) tGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAAc < 1:6595622/71‑1 (MQ=255) aGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCg > 1:956456/1‑69 (MQ=255) taTCGAAGGTAACTTCGATCTCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCgg > 1:2266511/2‑69 (MQ=38) taTCGAAGGTAACTTCGATCTCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCgg > 1:322143/2‑69 (MQ=38) taTCGAAGGTAACTTCGATCTCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGt > 1:1304122/2‑70 (MQ=38) taTCGAAGGTAACTTCGATCTCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGt > 1:3985335/2‑70 (MQ=38) taTCGAAGGTAACTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGt > 1:1383877/2‑70 (MQ=255) gATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTa < 1:6774982/71‑1 (MQ=255) aTCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAg < 1:4438990/55‑1 (MQ=255) aTCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAg < 1:244803/55‑1 (MQ=255) aTCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAg < 1:2607715/55‑1 (MQ=255) aTCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAg < 1:2622870/55‑1 (MQ=255) aTCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAg < 1:6159224/55‑1 (MQ=255) aTCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATaaa < 1:5552084/60‑1 (MQ=255) aTCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATaaa < 1:3096015/60‑1 (MQ=255) aTCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATaaa < 1:5041751/60‑1 (MQ=255) aTCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATaaa < 1:1901447/60‑1 (MQ=255) aTCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAAc < 1:5286095/63‑1 (MQ=255) tCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGt > 1:5000742/1‑68 (MQ=255) tCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGt > 1:4455031/1‑68 (MQ=255) tCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGt > 1:6613648/1‑68 (MQ=255) tCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTaaa < 1:4565934/71‑1 (MQ=255) tCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTaaa < 1:6057743/71‑1 (MQ=255) cGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTa > 1:3307567/1‑68 (MQ=255) cGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTa > 1:326927/1‑68 (MQ=255) gAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTaaa > 1:4019769/1‑69 (MQ=255) gAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTaaa > 1:1434893/1‑69 (MQ=255) gAAGGTAACTTCGATCTCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTAAag < 1:476033/70‑1 (MQ=38) aaGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCCCGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTaaa > 1:4243467/1‑68 (MQ=255) aaGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTaaa > 1:2492849/1‑68 (MQ=255) aaGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTaaa > 1:442240/1‑68 (MQ=255) aaGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTaaa > 1:901120/1‑68 (MQ=255) aaGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTaaa > 1:804194/1‑68 (MQ=255) aaGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTaa > 1:2008821/1‑67 (MQ=255) aGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTAAagag > 1:2340652/1‑70 (MQ=255) aGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTACCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTAAagag > 1:6350295/1‑70 (MQ=255) ttACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGATAGATAAAAACAGCGGTa < 1:4535994/63‑1 (MQ=255) ttACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTAAAGAGCag < 1:2702548/71‑1 (MQ=255) | ACAAATCTCTGGGTCAGTTCAACCTAGATGGTATCAACCCGGCACCGCGCGGCATGCCGCAGATCGAAGTTACCTTCGATATCGATGCTGACGGTATCCTGCACGTTTCCGCGAAAGATAAAAACAGCGGTAAAGAGCAG > minE/13514‑13653 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |