| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 436833 | 53 (1.080) | 79 (1.620) | 40/100 | NT | 61.0% | coding (546/546 nt) | seqA | regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | 1803907 = | 48 (0.980) | intergenic (+63/‑28) | ygaH/mprA | predicted inner membrane protein/DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
TATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTT > minE/1803838‑1803976 | tatataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCg > 1:1919855/1‑71 (MQ=255)atcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCg > 1:116234‑M2/70‑71 (MQ=255)atcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCg > 1:2150430‑M2/70‑71 (MQ=255) tataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCgg < 1:1317879/70‑1 (MQ=255) gaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGc < 1:2973935‑M2/4‑1 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:206530‑M2/7‑1 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:151613‑M2/7‑1 (MQ=255) aaCCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTg > 1:1719080/1‑70 (MQ=255) aCCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:1284971/70‑1 (MQ=255) cacaAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCtta < 1:2660031/67‑3 (MQ=255) cacaAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:2893194/71‑1 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:719871‑M2/11‑1 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:891358‑M2/11‑1 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa < 1:1315005‑M2/13‑1 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt < 1:765829/71‑1 (MQ=255) tgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATg < 1:2363906‑M2/15‑1 (MQ=255) aGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:2764695/71‑1 (MQ=255) agtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:2515213‑M2/14‑1 (MQ=255) agtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt < 1:1450291‑M2/14‑1 (MQ=255) aTCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAgg < 1:2070005/71‑1 (MQ=255) cATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:904400/62‑1 (MQ=255) aTTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGa > 1:589150/1‑66 (MQ=255) tttttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCg < 1:967411/51‑1 (MQ=255) gatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCAt < 1:3038523‑M2/22‑1 (MQ=255) gatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCAt < 1:2296051‑M2/22‑1 (MQ=255) tttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTc < 1:563789/67‑1 (MQ=255) tttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAc > 1:3046598/1‑71 (MQ=255) gcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCg > 1:2685474‑M2/47‑48 (MQ=255) gcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGaaa > 1:2332345‑M2/47‑55 (MQ=255) gcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:117695‑M2/11‑1 (MQ=255) gcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:1227221‑M2/47‑71 (MQ=255) gcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:738223‑M2/47‑71 (MQ=255) aattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAccc > 1:2747581‑M2/45‑70 (MQ=255) attcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTa > 1:2132266‑M2/44‑55 (MQ=255) ttcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatcttaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:77192‑M2/27‑1 (MQ=255) ttcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:1977196‑M2/43‑71 (MQ=255) ttcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:2477434‑M2/27‑1 (MQ=255) ttcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:836232‑M2/27‑1 (MQ=255) tcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAAt > 1:1138379‑M2/42‑71 (MQ=255) cccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTc > 1:943386‑M2/41‑60 (MQ=255) aaCAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:1200465/71‑1 (MQ=255) ccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:914704‑M2/40‑52 (MQ=255) ggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:656522‑M2/7‑1 (MQ=255) ggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAccc < 1:1879203‑M2/26‑1 (MQ=255) aTACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:1222455/43‑1 (MQ=255) cggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGaaa > 1:732886‑M2/36‑44 (MQ=255) cggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAg > 1:112562‑M2/36‑71 (MQ=255) gaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaa < 1:2621279‑M2/28‑1 (MQ=255) aTTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTc < 1:82592/71‑1 (MQ=255) tttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTc < 1:1326918/70‑1 (MQ=255) attgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAAt > 1:2632449‑M2/32‑61 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt < 1:2549165‑M2/41‑1 (MQ=255) tgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:2453800‑M2/30‑71 (MQ=255) tACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:1142875/1‑71 (MQ=255) tACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:2359967/1‑71 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGa > 1:1891355‑M2/29‑44 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGa > 1:643293‑M2/29‑44 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:2368563‑M2/29‑57 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:1409690‑M2/27‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:1114434‑M2/27‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:2239681‑M2/42‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:348283/70‑1 (MQ=255) cTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAAt < 1:1791525/57‑1 (MQ=255) tgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:1067304‑M2/26‑54 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg > 1:432686/1‑39 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:190514/55‑1 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:1083194/55‑1 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:1098145/55‑1 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:186857/55‑1 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTAc < 1:424283/69‑1 (MQ=255) aTTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGcc > 1:510888/1‑71 (MQ=255) tttGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:1616269/1‑43 (MQ=255) tttGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGcc < 1:1019667/70‑1 (MQ=255) taggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCa > 1:1353697‑M2/22‑71 (MQ=255) aaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGccc > 1:2864307‑M2/22‑70 (MQ=255) aggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAt < 1:127155‑M2/51‑1 (MQ=255) aggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAt < 1:856566‑M2/51‑1 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt > 1:94277/1‑62 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt > 1:1642286/1‑62 (MQ=255) ttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGaa > 1:100448‑M2/17‑71 (MQ=255) aCTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1193701/58‑1 (MQ=255) aCTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGccc < 1:1745806/65‑1 (MQ=255) tgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGaa > 1:1780536‑M2/16‑70 (MQ=255) ggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa < 1:625694‑M2/57‑1 (MQ=255) gaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:2967805‑M2/12‑55 (MQ=255) gTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATg > 1:982332/1‑71 (MQ=255) gTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATg > 1:2373925/1‑71 (MQ=255) gTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGGCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACaa < 1:860704/68‑1 (MQ=255) aactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:462063‑M2/31‑1 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1659569‑M2/42‑1 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1662985‑M2/42‑1 (MQ=255) atatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaaa > 1:357603/1‑71 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:1143957/1‑47 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaaa > 1:880506/1‑70 (MQ=255) atCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt > 1:667798/1‑45 (MQ=255) atCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt > 1:639421/1‑45 (MQ=255) atCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt > 1:1984340/1‑70 (MQ=255) aaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:1470363‑M2/3‑37 (MQ=255) aaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt > 1:2247697‑M2/3‑70 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAttt < 1:183418‑M2/70‑1 (MQ=255) | TATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTT > minE/1803838‑1803976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |