| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 204714 = | NA (NA) | 6 (0.130) | 3/86 | NT | NA | noncoding (131/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | minE | 204732 = | NA (NA) | noncoding (149/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
CTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < minE/204788‑204714‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acacactATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAGGAA > minE/204732‑204800 CTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:2070390/71‑1CTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:1071482/1‑71CTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:3394692/71‑1CTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:219877/1‑71CTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:1542940/1‑71 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:2117205/1‑71 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:1075578/1‑71 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:2680404/1‑71 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:133957/1‑71 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:2574665/1‑71 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:2573958/1‑71 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:3469149/1‑66 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2959013/1‑66 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2421386/1‑66 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATTGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT > 1:19077/1‑71 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:1367279/71‑1 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:2995500/71‑1 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT > 1:2088147/1‑71 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT < 1:960489/71‑1 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC < 1:3300334/70‑1 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC < 1:2512375/70‑1 TTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:3257568/1‑71 TTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:3113787/1‑71 TCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC < 1:2453365/64‑1 TCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC < 1:1245818/64‑1 AGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:2550473/71‑1 AGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:618551/71‑1 AGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:2566341/71‑1 AGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:553549/1‑62 CCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:81153/1‑54 CCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:1553509/1‑54 CCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:1723796/1‑51 CCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2254409/1‑51 GGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:622115/1‑53 GGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:2565056/1‑53 GGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:3286648/1‑53 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC < 1:1822237/45‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC < 1:1818141/45‑1 TCATTAAACTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:1912703/1‑42 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:3319559/1‑41 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:3400953/1‑41 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:1047186/1‑41 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:2352824/1‑40 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:1524981/1‑40 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:2356754/1‑40 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:2049886/1‑40 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:1809460/1‑42 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:374434/1‑42 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:143601/1‑42 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:633207/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:1154355/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:524200/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:28247/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:1271480/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2384087/1‑38 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:679549/1‑40 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:685995/1‑40 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:3006553/1‑40 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:2369508/1‑40 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACAC > 1:1888260/1‑40 TGATAGTGTGTCGAAACACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAA > 1:2545017/1‑71 TGATAGTGTGTCGAAACACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAA > 1:3476884/1‑71 TGATAGTGTGTCGAAACACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAA > 1:2239655/1‑71 TCGAAACACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGT < 1:870779/70‑1 ACACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCG < 1:1022902/71‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCG < 1:1994017/70‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:1186399/1‑69 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:1786547/1‑69 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:3403759/1‑69 ACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC < 1:1686150/68‑1 CACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAA < 1:2427608/52‑1 CACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACT < 1:2936333/49‑1 CACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGG < 1:2768345/45‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTATTGAGGCGAACCGGGGGAACTGAA < 1:1254317/51‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAGG > 1:501820/1‑70 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAGG > 1:3206297/1‑70 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAGG > 1:3210271/1‑70 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAA < 1:62293/51‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAA < 1:2823410/51‑1 CTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAGGAA < 1:89690/71‑1 CTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAA > 1:1198042/1‑45 CTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGG < 1:2793674/43‑1 CTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGG < 1:3435814/43‑1 CTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGG < 1:158956/41‑1 TATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGA < 1:201512/48‑1 CTTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < minE/204788‑204714‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acacactATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAGGAA > minE/204732‑204800 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |