| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 436259 = | 39 (0.730) | 75 (1.520) | 44/92 | NT | 71.1% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | = 2706018 | 25 (0.510) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GGCACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTGCCCGC > minE/2705948‑2706087 | ggcACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAaata < 1:2866037/71‑1 (MQ=255) acGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAatt < 1:1503941‑M2/69‑4 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcag > 1:3185400‑M2/1‑65 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcag > 1:3456595‑M2/1‑65 (MQ=255) gTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagc < 1:1224163‑M2/71‑8 (MQ=255) gTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa < 1:3068612‑M2/65‑2 (MQ=255) gTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa < 1:814379‑M2/65‑2 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:1659898‑M2/1‑61 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAg > 1:2461166/1‑70 (MQ=255) aGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACAAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGga > 1:2762296/1‑69 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGTTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa < 1:2371181‑M2/57‑2 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacac > 1:416019‑M2/1‑56 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagaca > 1:2619446‑M2/1‑56 (MQ=255) tGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:2753238‑M2/1‑55 (MQ=255) ggACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactg < 1:3285682‑M2/71‑18 (MQ=255) gACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgc > 1:1578198‑M2/1‑53 (MQ=255) gACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactg > 1:2588787‑M2/1‑53 (MQ=255) gACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGAgg < 1:2015419/71‑1 (MQ=255) gAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAaata < 1:2269347/50‑1 (MQ=255) aCTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATtctc < 1:1166922/54‑1 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactgga < 1:1621426‑M2/71‑25 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactgga < 1:1135674‑M2/71‑25 (MQ=255) ctgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:2004667‑M2/1‑47 (MQ=255) tgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggat < 1:1552863‑M2/71‑26 (MQ=255) ctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagaca < 1:1160991‑M2/58‑15 (MQ=255) tgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggatt < 1:559901‑M2/69‑27 (MQ=255) gCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaaga > 1:950010‑M2/1‑41 (MQ=255) cTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagat > 1:1436788‑M2/1‑40 (MQ=255) ttGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTAttt > 1:42593/1‑70 (MQ=255) tGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatga > 1:2899227‑M2/1‑37 (MQ=255) tGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatg > 1:1736926‑M2/1‑37 (MQ=255) tGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTAttt < 1:1881323/69‑1 (MQ=255) tGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTg > 1:2452951/1‑70 (MQ=255) tGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTg > 1:922215/1‑70 (MQ=255) tGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGa > 1:1900405/1‑71 (MQ=255) gTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa < 1:3167523‑M2/37‑2 (MQ=255) gTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa < 1:2228068‑M2/37‑2 (MQ=255) tACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaa < 1:518160‑M2/71‑37 (MQ=255) cAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaac < 1:2628463‑M2/70‑38 (MQ=255) cAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagcta > 1:1040545‑M2/1‑33 (MQ=255) aaCCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactg > 1:3328459‑M2/1‑31 (MQ=255) aCCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgat < 1:889234‑M2/70‑41 (MQ=255) aCCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga < 1:249272‑M2/42‑13 (MQ=255) aCCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagct > 1:809911‑M2/1‑30 (MQ=255) aCCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagct > 1:1091772‑M2/1‑30 (MQ=255) aCCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagct > 1:137571‑M2/1‑30 (MQ=255) ccAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgca < 1:180968‑M2/48‑20 (MQ=255) ggAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaag < 1:2161600‑M2/71‑46 (MQ=255) ggAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaag > 1:1645105‑M2/1‑26 (MQ=255) tCGTTTCACCCGCTAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAg < 1:1997429/49‑1 (MQ=255) tCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttga < 1:1423046‑M2/71‑50 (MQ=255) tCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaac > 1:47303‑M2/1‑22 (MQ=255) tCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggatta > 1:2793846‑M2/1‑22 (MQ=255) tCGTTTCACCC‑CGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgat > 1:312551‑M2/1‑21 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagtt < 1:759629‑M2/67‑48 (MQ=255) tttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaa > 1:3195995‑M2/1‑19 (MQ=255) tttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaa > 1:55641‑M2/1‑19 (MQ=255) tttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgc > 1:825809‑M2/1‑19 (MQ=255) tttCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGt < 1:1376941/71‑1 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgat < 1:1893594‑M2/70‑54 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgat < 1:3283333‑M2/70‑54 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaaga < 1:529839‑M2/47‑31 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaaga < 1:932204‑M2/47‑31 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattaagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgat < 1:368192‑M2/70‑54 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTc < 1:2579088/70‑1 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCg > 1:1851657/1‑71 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCg > 1:3160997/1‑71 (MQ=255) cACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatg > 1:3064646‑M2/1‑16 (MQ=255) cgcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:458559‑M2/71‑60 (MQ=255) cgcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:1582630‑M2/71‑60 (MQ=255) cgcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:330259‑M2/71‑60 (MQ=255) gcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:3380529‑M2/70‑60 (MQ=255) gcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:2802681‑M2/70‑60 (MQ=255) cgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgataaactcta > 1:841138‑M2/1‑10 (MQ=255) cgAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGAtt < 1:3341094/71‑1 (MQ=255) cgAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGAtt < 1:2356253/71‑1 (MQ=255) gAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGAttt > 1:166468/1‑71 (MQ=255) aaaaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactcta < 1:793507‑M2/69‑62 (MQ=255) aaaaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattg > 1:1285361‑M2/1‑8 (MQ=255) aaaaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattg > 1:2345478‑M2/1‑8 (MQ=255) aaaaaTAattcagctaagacactgtactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacag < 1:1247242‑M2/71‑65 (MQ=255) aaaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctaca > 1:1275891‑M2/1‑7 (MQ=255) aaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagc < 1:2401729‑M2/70‑66 (MQ=255) aaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttga < 1:226835‑M2/54‑50 (MQ=255) aaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaa > 1:2282837‑M2/1‑5 (MQ=255) aaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaa > 1:2278793‑M2/1‑5 (MQ=255) aataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta > 1:2980965‑M2/1‑4 (MQ=255) aataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta > 1:2084879‑M2/1‑4 (MQ=255) aataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta > 1:870103‑M2/1‑4 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctat > 1:384701‑M2/1‑3 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctat > 1:1799049‑M2/1‑3 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctat > 1:2148744‑M2/1‑3 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta < 1:2230234‑M2/70‑68 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta < 1:1039905‑M2/70‑68 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta < 1:1393309‑M2/70‑68 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta < 1:2197044‑M2/70‑68 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta < 1:2212338‑M2/70‑68 (MQ=255) ataatTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTGCCCg < 1:3207967/71‑1 (MQ=255) taattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctata < 1:347452‑M2/71‑70 (MQ=255) taattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctat < 1:2968970‑M2/70‑69 (MQ=255) | GGCACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTGCCCGC > minE/2705948‑2706087 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |