New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | W3110S.gb | = 225915 | NA (NA) | 3 (0.090) | 3/82 | NT | NA | noncoding (157/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
? | W3110S.gb | = 225926 | NA (NA) | noncoding (168/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/225838‑225915 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcattaacCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATA < W3110S.gb/225926‑225858 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:1007541/71‑1 GGTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT > 1:833641/1‑71 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:676402/71‑1 GTAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTT‑CGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:782314/1‑71 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:379422/1‑71 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:533311/1‑71 TAAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:217769/71‑1 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT > 1:3321762/1‑71 AAGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA < 1:3192056/70‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2178745/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1742122/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1577415/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2949732/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2956264/71‑1 AGGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT < 1:3423890/70‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:424006/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:472317/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:2984381/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:2657759/71‑1 GGTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:143741/1‑70 GTGATATGAACCGTTATAACCTGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACGCACTATCATTAA > 1:1878421/1‑71 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:2526115/1‑71 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA > 1:3696180/1‑70 GTGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTCCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:224702/71‑1 TGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:1199003/1‑71 TGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA < 1:3584516/70‑1 TGATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACACAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAAC > 1:1479665/1‑71 GATATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA > 1:3239520/1‑68 ATGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:181289/1‑64 TGAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:1252323/63‑1 GAACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC > 1:569421/1‑59 ACCGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTAT < 1:3286476/56‑1 CGTTATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATC < 1:1129036/55‑1 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAA > 1:3412265/1‑56 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT > 1:3346638/1‑54 ATAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCA > 1:2733865/1‑52 TAACCGGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTA < 1:420446/71‑1 GGCGATTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:274258/48‑1 TTTCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCAT < 1:295030/42‑1 TCCGAATGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTA < 1:2780197/42‑1 TGGGGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATT < 1:2206253/35‑1 GGAAACCCAGTGTGTTTCGACACACTATCATTAACCTATGGATTCAGTTAA < 1:782759/51‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCG > 1:2060751/1‑71 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGA < 1:3311123/63‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCG < 1:2421127/61‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCAT > 1:3639479/1‑58 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCC < 1:2119385/56‑1 TCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:213265/38‑1 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCAT > 1:529642/1‑57 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGG > 1:532547/1‑48 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:1467549/1‑43 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:1074788/1‑43 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:780572/1‑43 CATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAA < 1:2163542/38‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:3506620/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:3452371/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:2533718/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1850223/1‑71 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT < 1:1161240/71‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCC < 1:2646775/68‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCC > 1:1789368/1‑68 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAAT > 1:1328018/1‑64 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAA < 1:3475756/62‑1 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTT > 1:751882/1‑50 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:3573928/1‑42 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:128075/1‑42 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:1029990/1‑42 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:401661/1‑41 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:93283/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:3147862/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:2581984/1‑38 ATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:1761470/36‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTT < 1:551578/71‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1797538/1‑70 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGA < 1:3350555/60‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGA < 1:2977180/60‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGG < 1:3657172/45‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGG < 1:1636012/45‑1 TTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGA < 1:676370/35‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:26587/1‑71 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT < 1:864187/69‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGT > 1:1933848/1‑69 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:1228407/39‑1 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA > 1:1789926/1‑38 TAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:1982065/1‑36 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:2902082/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:621627/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:166332/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTA > 1:1593822/1‑70 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCA > 1:2161392/1‑52 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCC > 1:1220275/1‑49 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTC > 1:2906563/1‑48 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTG > 1:712376/1‑42 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT > 1:1657645/1‑41 AACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAA > 1:3354832/1‑35 tCCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTAT < 1:574227/69‑1 ACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCTGAAATCGCCGGTTAT < 1:552709/70‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |