| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2401919 | 28 (0.730) | 19 (0.610) +GGCATTTCA |
6/80 | NT | 41.0% | coding (194/978 nt) | nuoH | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit H |
| ? | W3110S.gb | = 2562879 | 39 (1.020) | coding (1247/1362 nt) | eutB | ethanolamine ammonia‑lyase, large subunit, heavy chain | |||||
GTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCC > W3110S.gb/2562809‑2562948 | gTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGAGGGGCGCAGGTTGAGTAACTGAc > 1:3627805/1‑71 (MQ=255)gTTTGCCATAATGCCAATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGAc > 1:2824463/1‑71 (MQ=255) gCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGca < 1:221625/70‑1 (MQ=255) ccATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGca > 1:469214/1‑69 (MQ=255) cATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAg < 1:2437016/71‑1 (MQ=255) tAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTg > 1:35511/1‑71 (MQ=255) tAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTg > 1:1897489/1‑71 (MQ=255) tAATGACCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTg > 1:3093056/1‑71 (MQ=255) aTGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGc > 1:1962138/1‑71 (MQ=255) aTGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGc > 1:2439333/1‑71 (MQ=255) cccATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGcaca > 1:2530504/1‑63 (MQ=255) cccATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCgg > 1:1808688/1‑70 (MQ=255) aTGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATc > 1:3561309/1‑71 (MQ=255) gCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATctt > 1:3453722/1‑69 (MQ=255) tCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTgg < 1:2403068/69‑1 (MQ=255) agccagcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGc > 1:228869/1‑71 (MQ=255) agcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCggtg > 1:1949273/1‑71 (MQ=255) agcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCggtg > 1:2167852/1‑71 (MQ=255) agcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCggtg < 1:1526279/71‑1 (MQ=255) gcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGcaca < 1:3351156/46‑1 (MQ=255) gcGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGaa > 1:507940/1‑63 (MQ=255) cAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGcaca > 1:558185/1‑41 (MQ=255) cAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTgg > 1:771162/1‑71 (MQ=255) aaaCTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGca < 1:2204403/38‑1 (MQ=255) aaCTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTa < 1:3598283/71‑1 (MQ=255) cTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGt > 1:1655993/1‑71 (MQ=255) tCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAg > 1:3108523/1‑69 (MQ=255) tCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGtt > 1:3321576/1‑71 (MQ=255) tCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGtt > 1:1214216/1‑71 (MQ=255) ccGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGtt > 1:2641220/1‑70 (MQ=255) cGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGtt > 1:2029457/1‑69 (MQ=255) cGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGtt > 1:2778352/1‑69 (MQ=255) cGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGa < 1:514622/71‑1 (MQ=255) gTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCCCAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAg > 1:5490/1‑70 (MQ=255) aCGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCat < 1:1422915/70‑1 (MQ=255) aCGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCat > 1:3471101/1‑70 (MQ=255) aCGGGAGAAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCat > 1:1351758/1‑70 (MQ=255) gggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTg > 1:3541820/1‑63 (MQ=255) gggCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatgat < 1:116680/71‑1 (MQ=255) gcAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGaa > 1:1336272/1‑40 (MQ=255) aGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcat > 1:434170/1‑70 (MQ=255) ggTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcatca > 1:1425587/1‑71 (MQ=255) gTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCa < 1:1388797/59‑1 (MQ=255) attgAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctt > 1:1855967‑M2/2‑14 (MQ=255) attgAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttct > 1:1747561‑M2/2‑14 (MQ=255) attgAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttct > 1:2504697‑M2/2‑14 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctttac > 1:892093‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctttac > 1:1275700‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttta < 1:3103012‑M2/37‑25 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttta > 1:844833‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttt > 1:921604‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctt > 1:2656725‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctt < 1:1829695‑M2/35‑23 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctt > 1:1401993‑M2/1‑13 (MQ=255) ttGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctt > 1:3054756‑M2/1‑13 (MQ=255) tGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctttac > 1:3007302‑M2/1‑12 (MQ=255) tGAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttta < 1:777630‑M2/36‑25 (MQ=255) gAGTAACTGACttaaatgcctcaaaatgttctttac < 1:2594371‑M2/36‑26 (MQ=255) gAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttctttac < 1:3265652‑M2/36‑26 (MQ=255) gAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttta < 1:957725‑M2/35‑25 (MQ=255) gAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttta < 1:3512628‑M2/35‑25 (MQ=255) gAGTAACTGACtgaaatgcctcaaaatgttcttta < 1:2389498‑M2/35‑25 (MQ=255) aGTAACTGACGCACAGTGGCAGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAg < 1:1200130/71‑1 (MQ=255) gTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCat < 1:3239446/55‑1 (MQ=255) gTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGc > 1:1542487/1‑71 (MQ=255) tAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCgg < 1:2862786/35‑1 (MQ=255) cTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCa < 1:2536762/71‑1 (MQ=255) cTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCa < 1:2249288/71‑1 (MQ=255) gACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATc > 1:2725070/1‑71 (MQ=255) aCGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATcc > 1:3473772/1‑71 (MQ=255) aCGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATcc > 1:2422896/1‑71 (MQ=255) cGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGtcat > 1:3675150/1‑55 (MQ=255) | GTTTGCCATAATGCCCATGCTTTCCAGCCAGCGTTCAAACTCCGGTGACGGGCGCAGGTTGAGTAACTGACGCACAGTGGCGGTATCGTGGAATGCGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCATCACCCAGCGGCATCC > W3110S.gb/2562809‑2562948 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |