| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 205097 = | 34 (0.850) | 65 (2.200) +TTATAACATTTTA |
20/74 | NT | 65.1% | intergenic (+8/‑29) | rnhB/dnaE | ribonuclease HII, degrades RNA of DNA‑RNA hybrids/DNA polymerase III alpha subunit |
| ? | W3110S.gb | 4139149 = | 60 (1.510) | coding (2/1023 nt) | frlB | fructoselysine‑6‑P‑deglycase | |||||
GACATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < W3110S.gb/205130‑205097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTTATTTTCTCCAGA > W3110S.gb/4139149‑4139165 ||||||||||||| gtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:1714113/3‑57gtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA < 1:203545/51‑1gtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTT < 1:803940/50‑1gtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTA < 1:487847/45‑1gtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT < 1:1044703/44‑1 tCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:2812759/58‑1 CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:2564627/1‑60 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT < 1:2810462/54‑1 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT < 1:3629372/54‑1 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:2344677/1‑54 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA > 1:842282/1‑50 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA > 1:2965874/1‑50 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTA < 1:1588694/44‑1 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTA < 1:683829/44‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCTACTTATAACATTTTAATTTTA < 1:1372804/49‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:1564310/59‑2 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:2845101/51‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:3027318/51‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:3437955/51‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA < 1:1419395/49‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA < 1:2247673/49‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT < 1:1374255/42‑1 CTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTC < 1:3776811/53‑1 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:2874066/1‑56 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:2222757/1‑56 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC > 1:1241181/1‑54 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC > 1:2122884/1‑54 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTT > 1:2688206/1‑45 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATT > 1:2095547/1‑44 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT > 1:1037532/1‑43 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACA < 1:197920/36‑1 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAAC > 1:3385982/1‑35 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAAC > 1:1612197/1‑35 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAAC > 1:2635542/1‑35 TCAGATTCCGGTTTACTTAATCTGGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:1129449/53‑1 TCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:1407366/1‑55 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC > 1:3075818/1‑52 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTAT > 1:3758936/1‑46 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT > 1:200796/1‑41 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT > 1:1621933/1‑41 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT > 1:1402228/1‑41 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACAT > 1:1721716/1‑35 AGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATT > 1:3167160/1‑41 GATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:9086/54‑3 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:2053472/53‑3 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:2191065/53‑3 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA < 1:1978034/51‑1 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:902480/44‑1 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:716179/44‑1 TCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT > 1:2835557/1‑42 TCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAA > 1:2332070/1‑35 CCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCaa > 1:763668/1‑46 CCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTT < 1:1851581/42‑1 CGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:3446300/49‑3 CGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:340670/49‑3 CGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:1481712/48‑2 CGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:24131/40‑1 GTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCC < 1:590859/44‑1 GTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTAT < 1:2104068/37‑1 GTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTAT < 1:425779/37‑1 GTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA < 1:3663111/36‑1 TTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:2185201/45‑2 TTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:837581/45‑2 TTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA > 1:1251374/1‑35 TTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt > 1:1410259/1‑43 TTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:77211/1‑43 TTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:3187293/41‑1 TTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTAT > 1:367837/1‑35 TACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:3309020/1‑42 TACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:603259/1‑42 TACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:247880/1‑42 TACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:2426753/1‑37 TACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTT > 1:2076032/1‑36 ACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTT < 1:2076584/35‑1 CTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:3684838/42‑3 CTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:3297504/42‑3 CTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:737921/38‑1 TTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:670833/40‑2 TTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:2608100/37‑1 TTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTC < 1:3054821/35‑1 TTAATCTCGACTTATAACATTTTAATATTATTTTCTC > 1:1066075/1‑37 AATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:3803339/1‑37 AATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCC > 1:846571/1‑36 AATCTCGACTTATAACATTTTAATTTAATTTTCTCCA > 1:2682144/1‑37 ||||||||||||| GACATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < W3110S.gb/205130‑205097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTTATTTTCTCCAGA > W3110S.gb/4139149‑4139165 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |