| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2107291 | 64 (1.610) | 128 (3.280) +A |
24/98 | NT | 71.3% | coding (904/993 nt) | wbbI | conserved hypothetical protein |
| ? | W3110S.gb | = 2809956 | 41 (1.030) | coding (531/531 nt) | mprA | DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
TCACCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATG > W3110S.gb/2809886‑2810021 | tCACCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTaa < 1:3264683/71‑1 (MQ=255) cACCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTaa > 1:1093280/1‑70 (MQ=255) cACCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTaa > 1:2724718/1‑70 (MQ=255) aCCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCTATGAGCTAAt < 1:2008889‑M2/70‑2 (MQ=255) aCCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTaa > 1:1488946/1‑69 (MQ=255) aCCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAt > 1:162705‑M2/1‑69 (MQ=255) aCCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAt < 1:32849‑M2/70‑2 (MQ=255) aCCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAt < 1:2560950‑M2/70‑2 (MQ=255) cccGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaa > 1:2124690‑M2/1‑68 (MQ=255) cccGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaa > 1:3737768‑M2/1‑68 (MQ=255) cccGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGAAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaa > 1:3110788‑M2/1‑68 (MQ=255) ccGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACTGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaat > 1:1682839‑M2/1‑67 (MQ=255) ccGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaat > 1:1445871‑M2/1‑67 (MQ=255) ccGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaa > 1:196985‑M2/1‑67 (MQ=255) cGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAt > 1:616161‑M2/1‑66 (MQ=255) gCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaata < 1:241406‑M2/70‑6 (MQ=255) gCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaata < 1:781796‑M2/70‑6 (MQ=255) gCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaata < 1:820342‑M2/70‑6 (MQ=255) gCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaata < 1:2523451‑M2/70‑6 (MQ=255) gCAAATTGCTATCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaata < 1:893932‑M2/70‑6 (MQ=255) cAAATTGCTCTCCCGTCTCGCCCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatac < 1:1752163‑M2/70‑7 (MQ=255) cAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatac < 1:2738523‑M2/70‑7 (MQ=255) cAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatac < 1:1470797‑M2/70‑7 (MQ=255) aaTTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaa > 1:2998124‑M2/1‑62 (MQ=255) aaTTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaa < 1:1875314‑M2/70‑9 (MQ=255) aTTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaa < 1:2674335‑M2/70‑10 (MQ=255) aTTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaa > 1:1816308‑M2/1‑61 (MQ=255) ttGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTaa > 1:2066129/1‑60 (MQ=255) ttGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaa < 1:3797635‑M2/71‑12 (MQ=255) ttGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaa < 1:225560‑M2/71‑12 (MQ=255) ttGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaa < 1:1332526‑M2/71‑12 (MQ=255) ttGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaa < 1:3236002‑M2/71‑12 (MQ=255) ttGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaa < 1:3066598‑M2/71‑12 (MQ=255) tGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaat < 1:3324290‑M2/71‑13 (MQ=255) gCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaat > 1:1555400‑M2/1‑58 (MQ=255) gCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaat < 1:528864‑M2/70‑13 (MQ=255) gCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaat > 1:437850‑M2/1‑58 (MQ=255) gCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaat < 1:3514368‑M2/70‑13 (MQ=255) gCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaata < 1:127807‑M2/63‑6 (MQ=255) gCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCg < 1:1916159/70‑1 (MQ=255) ctctCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaatt > 1:3041430‑M2/1‑57 (MQ=255) ctctCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaa > 1:444491‑M2/1‑57 (MQ=255) ctcCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatataaaaattag < 1:3808004‑M2/70‑16 (MQ=255) ctcCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaattag < 1:777382‑M2/70‑16 (MQ=255) tcCCGTCTCGACCATATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGATCTAAtaatacaaaaattag < 1:2236899‑M2/69‑16 (MQ=255) tcCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaattag < 1:2937909‑M2/69‑16 (MQ=255) tcCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaattag < 1:3685860‑M2/69‑16 (MQ=255) tcCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaattag > 1:964185‑M2/1‑54 (MQ=255) tcCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaattag > 1:2319808‑M2/1‑54 (MQ=255) tcCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaa > 1:1238478‑M2/1‑54 (MQ=255) tcCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaa > 1:1051775‑M2/1‑54 (MQ=255) tcCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaa > 1:3227118‑M2/1‑54 (MQ=255) cccGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaa < 1:238397‑M2/64‑12 (MQ=255) ccGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaattagg > 1:2164240‑M2/1‑52 (MQ=255) gTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTaa > 1:694463/1‑50 (MQ=255) gTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTaa > 1:3490228/1‑50 (MQ=255) gTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaattagg < 1:3416701‑M2/66‑17 (MQ=255) gTCTCGACCAGAAGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAta < 1:2146832‑M2/52‑3 (MQ=255) tctcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaattagg > 1:880062‑M2/1‑49 (MQ=255) tctcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaatt > 1:2204701‑M2/1‑49 (MQ=255) tctcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaat > 1:848607‑M2/1‑49 (MQ=255) tctcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAt > 1:319410‑M2/1‑49 (MQ=255) tctcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAt > 1:1408912‑M2/1‑49 (MQ=255) tcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaatta < 1:2224360‑M2/61‑15 (MQ=255) tcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaatta < 1:2271710‑M2/61‑15 (MQ=255) tcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaatta < 1:2392926‑M2/61‑15 (MQ=255) tcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaa < 1:1526787‑M2/58‑12 (MQ=255) tcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaa > 1:1167947‑M2/1‑47 (MQ=255) tcGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaa > 1:3854470‑M2/1‑47 (MQ=255) acgACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaa < 1:3578876‑M2/57‑12 (MQ=255) gACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAta < 1:2824412‑M2/47‑3 (MQ=255) gACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTc > 1:750254/1‑51 (MQ=255) gACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATc > 1:3610402/1‑67 (MQ=255) ccAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaa < 1:1887539‑M2/54‑12 (MQ=255) cAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAt > 1:3084220‑M2/1‑42 (MQ=255) aTGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaat > 1:573079‑M2/1‑39 (MQ=255) aTGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaat < 1:3557151‑M2/51‑13 (MQ=255) aTGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaat < 1:2687044‑M2/51‑13 (MQ=255) aTGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTtata < 1:3356594/71‑1 (MQ=255) tGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaattag < 1:2499611‑M2/53‑16 (MQ=255) tGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATaa < 1:448656/71‑1 (MQ=255) ggAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaa > 1:1583867‑M2/1‑37 (MQ=255) ggAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaa < 1:1137827‑M2/40‑4 (MQ=255) ggAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaa < 1:2627531‑M2/40‑4 (MQ=255) ggAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAt > 1:1001602‑M2/1‑37 (MQ=255) aaCAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAg < 1:1114576/71‑1 (MQ=255) gACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaat < 1:918020‑M2/42‑13 (MQ=255) aCGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaatt > 1:635236‑M2/1‑29 (MQ=255) aCGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaat > 1:2849260‑M2/1‑29 (MQ=255) cGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaa > 1:1310016‑M2/1‑28 (MQ=255) ggTGTGGTTCTCGTAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaattag > 1:218110‑M2/1‑27 (MQ=255) ggTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAAt < 1:1256252/70‑1 (MQ=255) gtgtGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGaaaa < 1:1838457/66‑1 (MQ=255) tgGTTCTCGAAGCGATGTGCTAAtaatacaaaaatta < 1:2442290‑M2/37‑15 (MQ=255) tgGTTCTCGAAGCGATGAGCTAAtaatacaaaaatta > 1:1450084‑M2/1‑23 (MQ=255) aaGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGaaaaaa > 1:3469295/1‑56 (MQ=255) gCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATaaaa > 1:2299627/1‑47 (MQ=255) gAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGa > 1:2932096/1‑52 (MQ=255) aGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGaaaa > 1:2695034/1‑46 (MQ=255) aGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATg > 1:1403528/1‑71 (MQ=255) | TCACCCGCAAATTGCTCTCCCGTCTCGACCAGATGGAACAAGACGGTGTGGTTCTCGAAGCGATGAGCTAACGCGTCATCTCGCTCAAAAATCCAGATTTATAAAAGAAAAAATGACTGGCCAGCATCGCAACATG > W3110S.gb/2809886‑2810021 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |