New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | W3110S.gb | = 315707 | NA (NA) | 46 (1.570) | 24/100 | NT | 100% | coding (654/687 nt) | ykgA | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
? | W3110S.gb | 576911 = | 0 (0.000) | coding (76/498 nt) | ybcS | predicted lysozyme |
CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/315638‑315707 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA > W3110S.gb/576911‑576979 CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:1615038/71‑1 CTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA > 1:1737483/1‑70 CTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:1567475/70‑1 CGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCC > 1:821800/1‑70 CAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:1315814/58‑1 TGAAAACAAGACCCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA > 1:152436/1‑53 TGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:189533/70‑1 TGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:1671446/70‑1 TGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAAC > 1:52613/1‑54 TGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA > 1:2631468/1‑53 AAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGA < 1:2355308/70‑1 AAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGA < 1:909553/70‑1 AACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCC < 1:1635100/56‑1 AACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA > 1:536857/1‑49 AACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA > 1:34499/1‑49 ACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGT > 1:784593/1‑71 AAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCT > 1:1778244/1‑71 GAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:840705/44‑1 GAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:1439587/44‑1 GAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:1745782/44‑1 CCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:494989/58‑1 GGCCTGTGGCCTTATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCT < 1:2787733/71‑1 GCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGT < 1:2695661/63‑1 GCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGT < 1:2134217/63‑1 GCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGT < 1:976334/63‑1 TGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:704422/43‑1 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCA > 1:1401764/1‑71 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTA < 1:1257057/64‑1 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:2383562/41‑1 CCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAAC < 1:975517/40‑1 CATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATA > 1:221165/1‑71 CATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATA > 1:1484085/1‑71 TATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTG < 1:2394083/46‑1 ATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA > 1:2686837/1‑61 ATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA > 1:1508687/1‑61 ATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGG > 1:2653850/1‑46 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAA < 1:2088094/71‑1 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:787808/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:1950025/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:454775/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:660538/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:1481632/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAA > 1:2112986/1‑47 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAA > 1:2239069/1‑47 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGA > 1:1037390/1‑46 ACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAATGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:1214075/1‑67 ACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:2647625/1‑67 CGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGA < 1:1835636/70‑1 CGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGA < 1:1761627/70‑1 TGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAA > 1:1002786/1‑42 TGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAA > 1:179377/1‑42 TGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGA > 1:1654704/1‑41 GGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTG < 1:766862/71‑1 GGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATT < 1:2557418/70‑1 GTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGG < 1:2338012/37‑1 TAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTC < 1:1663731/44‑1 AGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGG > 1:2595088/1‑39 GGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGG > 1:1071781/1‑71 GATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCATCTACATACCATACAAAGATAT < 1:1286569/64‑1 GATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAA < 1:526562/59‑1 GATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTA < 1:10123/46‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:164981/71‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:768575/71‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:1904617/71‑1 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:352190/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:1257054/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:1146116/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGG > 1:2755475/1‑68 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATA > 1:317023/1‑61 CAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA > 1:1761888/1‑71 CAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA > 1:2060058/1‑71 CAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGT > 1:2499818/1‑35 AACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA < 1:441299/70‑1 AACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA < 1:1881251/70‑1 AACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCA > 1:1785776/1‑49 CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/315638‑315707 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA > W3110S.gb/576911‑576979 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |