| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2412225 | NA (NA) | 35 (1.190) | 21/100 | NT | 97.2% | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/predicted aminotransferase |
| ? | W3110S.gb | = 3748807 | 1 (0.030) | coding (176/984 nt) | tnaB | tryptophan transporter of low affinity | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GATTAAATCTTTGGTGATGGTGTTAAAACTGGAGCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATAAAGGCACCCCAGAAAAACCAGGCACC > W3110S.gb/3748740‑3748877 | gATTAAATCTTTGGTGATGGTGTTAAAACTGGAGCCGAGGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggt > 1:1753663‑M2/1‑68 (MQ=255)gATTAAATCTTTGGTGATGGTGTTAAAACTGGAGCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggt < 1:2061600‑M2/71‑4 (MQ=255)gATTAAATCTTTGGTGATGGTGTTAAAACTGGAGCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggt > 1:2043872‑M2/1‑68 (MQ=255)acaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTaataacaat < 1:2737777‑M1/11‑1 (MQ=255)acaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTaataacaat < 1:71103‑M1/11‑1 (MQ=255) tAAATCTTTGGTGATGGTGTTAAAACTGGAGCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgat < 1:2438500‑M2/71‑7 (MQ=255) gtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTaataacaat < 1:1328053‑M1/11‑1 (MQ=255) gtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCg < 1:1788963‑M1/17‑1 (MQ=255) 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atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTaataacaataa < 1:1893489‑M1/13‑1 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTaataacaa < 1:1040413‑M1/10‑1 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTaataacaa < 1:696454‑M1/10‑1 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCAtt < 1:1260302‑M1/29‑1 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCAtt < 1:1916372‑M1/29‑1 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCAtt < 1:117216‑M1/29‑1 (MQ=255) tgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCAtt < 1:84178‑M1/29‑1 (MQ=255) tgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGaa < 1:2296902‑M1/32‑1 (MQ=255) aacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAg < 1:1662039‑M1/25‑1 (MQ=255) aacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGaa > 1:757158‑M1/37‑68 (MQ=255) aacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGaa > 1:2425263‑M1/37‑68 (MQ=255) acataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTaataacaa < 1:1698029‑M1/10‑1 (MQ=255) acataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTCaaa < 1:398312‑M1/33‑1 (MQ=255) aaaaCTGGAGCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttag < 1:2404344‑M2/71‑28 (MQ=255) aaaaCTGGAGCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttag < 1:863425‑M2/71‑28 (MQ=255) cataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTaataacaat > 1:1695094‑M1/35‑45 (MQ=255) cataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAAc < 1:2682504‑M1/35‑1 (MQ=255) cataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAAc < 1:2505807‑M1/35‑1 (MQ=255) taaaacactatcaataagttggagtcattaccCTaataacaataa < 1:114774‑M1/13‑1 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGc > 1:2792020‑M1/31‑70 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGc < 1:1451500‑M1/40‑1 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGc > 1:1086523‑M1/31‑70 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAA‑AACCCGGAATg < 1:278178‑M1/21‑1 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaacCTAATAACAATAACCCGGAATg < 1:2211093‑M1/22‑1 (MQ=255) gAGCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:690389‑M2/1‑37 (MQ=255) gCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 1:364420‑M2/71‑37 (MQ=255) ctatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGAt > 1:1318712‑M1/26‑71 (MQ=255) cGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 1:2697465‑M2/1‑33 (MQ=255) atcaataagttggagtcattaccCTaataacaataa < 1:116615‑M1/13‑1 (MQ=255) atcaataagttggagtcattaccCTaataacaataa < 1:122386‑M1/13‑1 (MQ=255) atcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGAt < 1:1866677‑M1/46‑1 (MQ=255) tcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGa < 1:1097777‑M1/19‑1 (MQ=255) tcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATg > 1:2377559‑M1/23‑66 (MQ=255) tcaataagttggagtcattaccCTAATAAAAATAACCCgg < 1:362419‑M1/18‑1 (MQ=255) caataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCa < 1:2752988‑M1/37‑1 (MQ=255) caataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCa < 1:1321469‑M1/37‑1 (MQ=255) ataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGAt > 1:933906‑M1/20‑71 (MQ=255) taagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGAt < 1:1983505‑M1/52‑1 (MQ=255) taagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa > 1:2142860‑M1/19‑71 (MQ=255) taagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa > 1:63385‑M1/19‑71 (MQ=255) taagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa > 1:1575961‑M1/19‑71 (MQ=255) taagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa > 1:1542059‑M1/19‑71 (MQ=255) gATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt > 1:1260194‑M2/1‑27 (MQ=255) gATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatt > 1:2178332‑M2/1‑27 (MQ=255) aTAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 1:1200119‑M2/1‑26 (MQ=255) aTAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 1:354354‑M2/1‑26 (MQ=255) agttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa < 1:2747464‑M1/53‑1 (MQ=255) aaTTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 1:1972825‑M2/1‑24 (MQ=255) aaTTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 1:426835‑M2/57‑34 (MQ=255) aaTTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtg > 1:1099004‑M2/1‑24 (MQ=255) ttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATAAAgg > 1:2324896‑M1/15‑71 (MQ=255) ttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATAAAgg > 1:362673‑M1/15‑71 (MQ=255) 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1:2377949‑M2/70‑68 (MQ=255) aCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg < 1:1866065‑M2/51‑49 (MQ=255) aCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg < 1:273869‑M2/51‑49 (MQ=255) caataacCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATAAAGGCACCCCAGAAAAACCAGGCa > 1:1718339/1‑70 (MQ=255) cAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 1:2103615‑M2/1‑2 (MQ=255) aggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct > 1:1697001‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct > 1:2294836‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtt > 1:2085094‑M2/1‑1 (MQ=255) | GATTAAATCTTTGGTGATGGTGTTAAAACTGGAGCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATAAAGGCACCCCAGAAAAACCAGGCACC > W3110S.gb/3748740‑3748877 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |