Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,235,640	+A	coding (655/1542 nt)	nhaB ←	sodium:proton antiporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,235,640	1	.	A	100.0%	171.9 / NA	51	V219L (GTG→TTG)	nhaB	sodium:proton antiporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/0);  new base A (12/39);  total (12/39)

CGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCAC‑CATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGACACCGGCATGCATCATCAGGCTA  >  W3110S.gb/1235605‑1235695                                     |                                                        cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCgttt                             <  1:396026/65‑4 (MQ=255) cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:573193/65‑1 (MQ=255) cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:3090184/65‑1 (MQ=255) cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:3014328/65‑1 (MQ=255) cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:2376725/65‑1 (MQ=255) cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:1852210/65‑1 (MQ=255) cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:2374795/65‑1 (MQ=255) cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:1902456/65‑1 (MQ=255) cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:235290/65‑1 (MQ=255) cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:2294658/65‑1 (MQ=255) cGCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:1990633/65‑1 (MQ=255)  gCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:2359697/64‑1 (MQ=255)  gCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGc                            <  1:2424798/65‑1 (MQ=255)  gCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGc                            <  1:974279/65‑1 (MQ=255)  gCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGc                            <  1:634801/65‑1 (MQ=255)  gCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGc                            <  1:2474367/65‑1 (MQ=255)  gCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGc                            <  1:147696/65‑1 (MQ=255)  gCTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGAGGTGc                            <  1:1695248/65‑1 (MQ=255)   cTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGc                            <  1:562957/64‑1 (MQ=255)   cTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGc                            <  1:1267872/64‑1 (MQ=255)   cTTTAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGc                            <  1:2465458/64‑1 (MQ=255)         cGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTg                             <  1:596892/57‑1 (MQ=39) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑