| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 2412225 | NA (NA) | 84 (2.130) | 5/122 | 0.2 | 95.5% | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/predicted aminotransferase |
| ? | W3110S.gb | = 3748807 | 4 (0.100) | coding (176/984 nt) | tnaB | tryptophan transporter of low affinity | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GATGGTGTTAAAACTGGAGCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATAAAGGCACCCCAGAAAAACC > W3110S.gb/3748755‑3748870 | attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAAt > 1:1031206‑M1/45‑65 (MQ=255)attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAAt > 1:1368686‑M1/45‑65 (MQ=255)attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAAt > 1:685747‑M1/45‑65 (MQ=255)attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAAt > 1:1419189‑M1/45‑65 (MQ=255)attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAAt > 1:1560421‑M1/45‑65 (MQ=255)attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAAt > 1:827925‑M1/45‑65 (MQ=255)attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAAt > 1:1801398‑M1/45‑65 (MQ=255)attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAAt > 1:845439‑M1/45‑65 (MQ=255)attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAAt > 1:1982542‑M1/45‑65 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1:1156939‑M2/1‑35 (MQ=255) gCCGACGGGATAATTTAAATTTGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:1404503‑M2/1‑35 (MQ=255) gttggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAAt > 1:2705987‑M1/16‑36 (MQ=255) ggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa > 1:405644‑M1/13‑65 (MQ=255) ggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa > 1:1248559‑M1/13‑65 (MQ=255) ggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa > 1:628947‑M1/13‑65 (MQ=255) ggagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa > 1:645104‑M1/13‑65 (MQ=255) gagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa > 1:2102886‑M1/12‑64 (MQ=255) gagtcattaccCTAATAACAATAACCCGGAATGAAGCATTGAAAACCAGGCAATGATAAGGATa > 1:625423‑M1/12‑64 (MQ=255) ttGCTTCTAATTACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 1:3003907‑M2/1‑15 (MQ=255) ttGCTTCTAATAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 1:412509‑M2/1‑15 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |