Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	417230	417238	9	20 [0]	[0] 3	phoR	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB

GCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTA  >  W3110S.gb/417165‑417229                                                                 | gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGTTa  <  1:449/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:3103061/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:989619/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:96651/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:73195/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:70574/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:67112/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:627875/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:1030678/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:2630493/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:2579185/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:2410646/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:235504/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:2332393/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:208553/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:1975744/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:1904378/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:1352424/65‑1 (MQ=255) gcCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGGTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:616506/65‑1 (MQ=255)  ccTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTa  <  1:426490/64‑1 (MQ=255)                                                                 | GCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTA  >  W3110S.gb/417165‑417229

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑