Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	417536	417571	36	7 [0]	[0] 7	phoR	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB

TTTTCTGGTGTAACGGTCTGGCGCAACAAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAG  >  W3110S.gb/417471‑417535                                                                 | ttttCTGGTGTAACGGTCTGGCGCAACAAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAg  <  1:1307853/65‑1 (MQ=255) ttttCTGGTGTAACGGTCTGGCGCAACAAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAg  <  1:1534087/65‑1 (MQ=255) ttttCTGGTGTAACGGTCTGGCGCAACAAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAg  <  1:1797443/65‑1 (MQ=255) ttttCTGGTGTAACGGTCTGGCGCAACAAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAg  <  1:2156418/65‑1 (MQ=255) ttttCTGGTGTAACGGTCTGGCGCAACAAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAg  <  1:2402524/65‑1 (MQ=255) ttttCTGGTGTAACGGTCTGGCGCAACAAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAg  <  1:525813/65‑1 (MQ=255) ttttCTGGTGTAACGGTCTGGCGCAACAAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAg  <  1:745082/65‑1 (MQ=255)                                                                 | TTTTCTGGTGTAACGGTCTGGCGCAACAAATTCTTGGTTTGCGCTGGCCGGAAGATAACGGGCAG  >  W3110S.gb/417471‑417535

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑