Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	525077	525936–525103	27–860	29 [1]	[1] 14	rhsD	rhsD element protein

AACTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTATATGA  >  W3110S.gb/525012‑525078                                                                 |   aaCTGACCAGCACATACACCCCTGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2687837/1‑65 (MQ=25) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTTGTatat    >  1:1417209/1‑65 (MQ=25) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:1364413/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:880464/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:84670/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:807653/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:474911/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:388205/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:343750/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2950192/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2860081/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2840541/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2720049/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2597380/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2536141/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2442009/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2392698/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2386808/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2363280/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2216026/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:2096421/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:1973288/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:1744638/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:1662448/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:1420628/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:1410987/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTatat    >  1:1093110/1‑65 (MQ=35) aaCTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTacat    >  1:2410139/1‑65 (MQ=14) aaCTGACCAGCACATACA‑‑CCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTATATGa  >  1:2379525/1‑65 (MQ=11)                                                                 |   AACTGACCAGCACATACACCCCCGCAGGCCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGGTATATGA  >  W3110S.gb/525012‑525078

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑