Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1041648	1041689	42	8 [0]	[0] 26	appA	phosphoanhydride phosphorylase

AAACGGCGTTTCGCGAACTGGAACGGGTGCTTAATTTTCCGCAATCAAACTTGTGCCTTAAACGT  >  W3110S.gb/1041583‑1041647                                                                 | aaaCGGCGTTTCGCGAACTGGAACGGGTGCTTAATTTTCCGCAATCAAACTTGTGCCTTAAACGt  <  1:1000011/65‑1 (MQ=255) aaaCGGCGTTTCGCGAACTGGAACGGGTGCTTAATTTTCCGCAATCAAACTTGTGCCTTAAACGt  <  1:1235058/65‑1 (MQ=255) aaaCGGCGTTTCGCGAACTGGAACGGGTGCTTAATTTTCCGCAATCAAACTTGTGCCTTAAACGt  <  1:1529912/65‑1 (MQ=255) aaaCGGCGTTTCGCGAACTGGAACGGGTGCTTAATTTTCCGCAATCAAACTTGTGCCTTAAACGt  <  1:3029994/65‑1 (MQ=255) aaaCGGCGTTTCGCGAACTGGAACGGGTGCTTAATTTTCCGCAATCAAACTTGTGCCTTAAACGt  <  1:321656/65‑1 (MQ=255) aaaCGGCGTTTCGCGAACTGGAACGGGTGCTTAATTCTCCGCAATCAAACTTGTGCCTTAAACGt  <  1:661721/65‑1 (MQ=255)  aaCGGCGTTTCGCGAACTGGAACGGGTGCTTAATTTTCCGCAATCAAACTTGTGCCTTAAACGt  <  1:975048/64‑1 (MQ=255)         tttCGCGAACTGGAACGGGTGCTTAATTTTCCGCAATCAAACTTGTGCCTTAAACGt  <  1:43672/57‑1 (MQ=255)                                                                 | AAACGGCGTTTCGCGAACTGGAACGGGTGCTTAATTTTCCGCAATCAAACTTGTGCCTTAAACGT  >  W3110S.gb/1041583‑1041647

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑