Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1140502	1140533	32	18 [0]	[0] 9	flgK	flagellar hook‑filament junction protein 1

GATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCAAA  >  W3110S.gb/1140437‑1140501                                                                 | gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:2405884/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:695083/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:650991/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:3591/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:3054815/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:2886139/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:2874249/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:2523943/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:2468848/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:1180465/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:2245241/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:2242456/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:1898253/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:1833304/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:1725524/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:1645898/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:1547484/1‑65 (MQ=255) gATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCaaa  >  1:1471765/1‑65 (MQ=255)                                                                 | GATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACGATCAAA  >  W3110S.gb/1140437‑1140501

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑