Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1193962	1193969	8	10 [0]	[0] 12	hflD	predicted lysogenization regulator

GCCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCGG  >  W3110S.gb/1193897‑1193961                                                                 | gcCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCgg  <  1:1356359/65‑1 (MQ=255) gcCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCgg  <  1:1399169/65‑1 (MQ=255) gcCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCgg  <  1:158915/65‑1 (MQ=255) gcCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCgg  <  1:1766250/65‑1 (MQ=255) gcCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCgg  <  1:2166997/65‑1 (MQ=255) gcCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCgg  <  1:2421722/65‑1 (MQ=255) gcCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCgg  <  1:2752190/65‑1 (MQ=255) gcCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCgg  <  1:2890574/65‑1 (MQ=255) gcCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCgg  <  1:527799/65‑1 (MQ=255) gcCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCgg  <  1:662062/65‑1 (MQ=255)                                                                 | GCCTTTCGCTGAGGAGAGTTTGCGCTCAAGCACCATCAAGCTGAGTGTGTAGCGGGTTAATTCGG  >  W3110S.gb/1193897‑1193961

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑