Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1287994	1288004	11	29 [0]	[0] 6	narI	nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit

CTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGC  >  W3110S.gb/1287929‑1287993                                                                 | cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1094976/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:974057/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:942024/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:732893/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:521532/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:517254/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:505805/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:348981/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:308959/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:3058718/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:2980660/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:2618400/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:2417380/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1886232/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1885588/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1789592/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1634314/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1485784/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1456879/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1407787/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1374573/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1241198/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1176571/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1100534/65‑1 (MQ=255) cTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:102463/65‑1 (MQ=255)  ttCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1991797/64‑1 (MQ=255)  ttCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:2965070/64‑1 (MQ=255)                ttCTCAACACCTCGATGGTGTTGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1944968/50‑1 (MQ=255)                   tcAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGc  <  1:1709/47‑1 (MQ=255)                                                                 | CTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGC  >  W3110S.gb/1287929‑1287993

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑