Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1291785	1291793	9	16 [0]	[1] 15	rssA/rssB	conserved hypothetical protein/response regulator of RpoS

ACATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATG  >  W3110S.gb/1291720‑1291784                                                                 | aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:1305106/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:1477257/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:1543712/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:1570677/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:2084072/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:2182111/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:224054/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:2387014/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:2726932/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:2890106/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:2957906/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:2986543/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:2992590/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:512741/65‑1 (MQ=255) aCATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:706284/65‑1 (MQ=255)  cATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATg  <  1:440176/64‑1 (MQ=255)                                                                 | ACATTTGACCAGAATTTTTATCTACACTTAAGTTAATTCTGACAGGCGCAGGTGGCAATAGCATG  >  W3110S.gb/1291720‑1291784

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑