Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1414407	1414431	25	15 [0]	[0] 7	intR	integrase

ATAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGA  >  W3110S.gb/1414343‑1414406                                                                | aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:108901/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:1182203/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:1743125/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:1838152/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:1873332/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:2048764/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:2284622/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:2453093/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:2623661/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:2725134/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:2890111/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:2970987/64‑1 (MQ=255) aTAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:4702/64‑1 (MQ=255)  tAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:2309888/63‑1 (MQ=255)  tAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGa  <  1:3054428/63‑1 (MQ=255)                                                                | ATAACGGATCAGGCTTTATTCTGTTTCGCTGTAATTTTTTTACTCCTTCAAATGGTTTGGTTGA  >  W3110S.gb/1414343‑1414406

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑