Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1430003	1430026	24	13 [0]	[0] 9	lomR insH	ECK1366:JW5884+JW5904:b4570; Rac prophage region; hypothetical protein IS5 transposase and trans‑activator

TCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAAT  >  W3110S.gb/1429953‑1430002                                                  | tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:1006180/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:1010824/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:1420985/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:1602127/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:2154022/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:2154302/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:2561462/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:2585579/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:263758/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:2730421/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:2985913/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:570443/1‑50 (MQ=38) tcCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat  >  1:774582/1‑50 (MQ=38)                                                  | TCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAAT  >  W3110S.gb/1429953‑1430002

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑