Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1606968	1606974	7	16 [1]	[0] 3	lsrB	AI2 transporter

AACGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCA  >  W3110S.gb/1606903‑1606969                                                                 |   aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGATcc    <  1:2989403/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:1295233/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:2109705/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:2247/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:2283769/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:2468145/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:2773301/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:2801700/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:2818834/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:2952909/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:90699/65‑1 (MQ=255) aaCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTAGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:3096950/65‑1 (MQ=255)  aCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:1316202/64‑1 (MQ=255)  aCGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:898184/64‑1 (MQ=255)   cGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCa  <  1:263315/65‑1 (MQ=255)              aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAAcc    <  1:684163/52‑1 (MQ=255)                                                                 |   AACGGCGCACAACAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCA  >  W3110S.gb/1606903‑1606969

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑