Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1977562	1977570	9	27 [0]	[0] 4	motB	protein that enables flagellar motor rotation

CGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATGGGG  >  W3110S.gb/1977497‑1977561                                                                 | cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTTGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2477473/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2422141/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:964232/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:920115/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:469464/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:37251/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:363952/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2922867/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2812244/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2588099/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2580465/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2432607/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1044235/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2420912/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2272781/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1940173/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1880229/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1625322/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1458735/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1206999/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:106495/65‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCATCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:1247108/65‑1 (MQ=255)  gATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:217764/64‑1 (MQ=255)  gATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:3016258/64‑1 (MQ=255)  gATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:460099/64‑1 (MQ=255)     tCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2225893/61‑1 (MQ=255)      cTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATgggg  <  1:2130161/60‑1 (MQ=255)                                                                 | CGATTCTGGCTATCGATGATCTGAATACGTAGACCTTCCTGGACCAGATCGATTTTGAGATGGGG  >  W3110S.gb/1977497‑1977561

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑