Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2165664	2165665	2	20 [0]	[0] 2	baeS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with BaeR

TTGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGAA  >  W3110S.gb/2165599‑2165663                                                                 | ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:2638334/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:98378/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:982140/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:770946/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:71720/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:669926/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:2765177/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:2682027/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:140252/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:2432513/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:2129592/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:2110395/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:2047339/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:1862035/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:1815300/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:1659948/65‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:1598720/65‑1 (MQ=255)  tGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:2869954/64‑1 (MQ=255)                       ggcggcGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:1526893/43‑1 (MQ=255)                             gggcgATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGaa  <  1:2685567/37‑1 (MQ=255)                                                                 | TTGTCGATGGCACGCACAAACTGGCGGCGGGCGATTTCACTACCCGCGTAACGCCCACCAGTGAA  >  W3110S.gb/2165599‑2165663

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑