Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2744433	2744449	17	13 [0]	[0] 17	rimM	16S rRNA processing protein

TGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATAA  >  W3110S.gb/2744372‑2744432                                                             | tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:1068249/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:1134776/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:1469037/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:2413885/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:2515940/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:2546292/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:2607841/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:3006397/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:3030516/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:404002/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:642891/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:735240/1‑61 (MQ=255) tGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATaa  >  1:879165/1‑61 (MQ=255)                                                             | TGATTGTGGTGCTTCCAGCTTTCCAGCTGGACTTGCTGCCACTGACCCGCCTTCTGGATAA  >  W3110S.gb/2744372‑2744432

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑