Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3122788	3122792	5	15 [0]	[0] 15	glcG	conserved hypothetical protein

AGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCAA  >  W3110S.gb/3122723‑3122787                                                                 | aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:1393551/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:1479969/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:1923953/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:206855/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:2187013/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:2217014/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:2644657/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:2882340/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:2918465/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:3044751/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:3058405/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:3093146/65‑1 (MQ=255) aGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:347254/65‑1 (MQ=255)  gCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:2226001/64‑1 (MQ=255)    cGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCaa  <  1:1176367/62‑1 (MQ=255)                                                                 | AGCCGCAATCGGCGCGCAATCGTCCATGCGACTTAACGCCAGCAGATGACCGCCGTCATCGGCAA  >  W3110S.gb/3122723‑3122787

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑