Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3169891	3169898	8	22 [0]	[0] 5	qseC	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with QseB

CACACATGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGCC  >  W3110S.gb/3169826‑3169890                                                                 | cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACTCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:2497275/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:2539394/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:990745/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:905592/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:862570/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:540875/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:408500/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:3096984/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:2819998/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:2789020/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:261734/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:1089697/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:2336696/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:1992386/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:190594/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:1751947/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:1532238/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:1488133/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:1233688/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:1135334/65‑1 (MQ=255) cacacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGATTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:1684599/65‑1 (MQ=255)   cacaTGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGcc  <  1:355740/63‑1 (MQ=255)                                                                 | CACACATGCGATGATGGTTCGTGAACGACGCTTTACCTCCGACGCAGCTCACGAACTTCGTAGCC  >  W3110S.gb/3169826‑3169890

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑