Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3212572	3212574	3	12 [0]	[0] 16	rpoD	RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor

TGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGCT  >  W3110S.gb/3212508‑3212571                                                                | tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGCTGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:2758540/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:1288044/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:1472882/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:1640812/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:1680936/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:1816753/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:2364174/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:2458797/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:3015801/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:323282/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:937472/64‑1 (MQ=255) tGGTCAACAGCATGCGCCTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGct  <  1:1621967/64‑1 (MQ=255)                                                                | TGGTCAACAGCATGCGCGTCATGATGGACCGCGTTCGTACGCAAGAACGTCTGATCATGAAGCT  >  W3110S.gb/3212508‑3212571

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑