Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3348372	3348413	42	20 [0]	[0] 18	yrbL	hypothetical protein

ATGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATCC  >  W3110S.gb/3348307‑3348371                                                                 | aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:2619899/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:997530/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:970910/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:654813/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:308560/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:2955960/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:2729933/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:2664046/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:2660712/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:1145394/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:2579200/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:2294574/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:2286344/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:2168322/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:2142754/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:1689487/65‑1 (MQ=255) aTGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:1308568/65‑1 (MQ=255)             tCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:449062/53‑1 (MQ=255)                          cccTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:1655608/40‑1 (MQ=255)                               ggCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATcc  <  1:1170729/35‑1 (MQ=255)                                                                 | ATGATTCGCTTATCTGAACAAAGTCCCCTGGGCACCGGAAGACATCGGAAATGTTATGCGCATCC  >  W3110S.gb/3348307‑3348371

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑