Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3954989	3954990	2	24 [0]	[1] 2	yhjK	predicted diguanylate cyclase

GGCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAG  >  W3110S.gb/3954924‑3954988                                                                 | ggCTACTCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:1456864/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCTACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:750679/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:2261516/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:976069/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:926972/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:923485/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:843409/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:428848/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:2895797/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:2541911/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:2428405/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:2321186/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:1009950/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:2255441/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:2002045/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:1923463/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:1518651/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:1485067/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:1358573/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:1172349/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:1154858/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:1078026/65‑1 (MQ=255) ggCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:102504/65‑1 (MQ=255)   cTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAg  <  1:461752/63‑1 (MQ=255)                                                                 | GGCTACGCAACTGGAAAGCATTGCTCGCTCTGTCCGCGAACCCTTATCTTCAGCTATTTTGAAAG  >  W3110S.gb/3954924‑3954988

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑