Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4083214	4083218	5	14 [0]	[0] 17	rtcB	conserved hypothetical protein

ACGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGA  >  W3110S.gb/4083149‑4083213                                                                 | aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:1019108/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:1138906/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:1143840/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:1158384/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:1160582/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:1594403/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:2292703/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:2325927/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:2782331/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:483378/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:863485/65‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:918214/65‑1 (MQ=255)  cGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:1059996/64‑1 (MQ=255)  cGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGa  <  1:1748255/64‑1 (MQ=255)                                                                 | ACGCTGGCGATGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCACTTTGGTGA  >  W3110S.gb/4083149‑4083213

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑