Missing coverage evidence...
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TGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACCAG  >  W3110S.gb/4110436‑4110500                                                                 | tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2425843/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:777151/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:715135/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:622101/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:606583/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:585087/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:467161/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:3034729/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2809992/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2774703/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2624412/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2528670/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2494915/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2458429/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:1086068/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2423711/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2386626/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2308506/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2210000/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:214305/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:2063403/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:1966019/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:1959306/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:1921097/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:1909681/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:1888291/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:1624978/65‑1 (MQ=255) tGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:1281366/65‑1 (MQ=255)             gTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:56649/53‑1 (MQ=255)                           aaaCTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACcag  <  1:1419284/39‑1 (MQ=255)                                                                 | TGCAGCTGTACGGTGATATCACCATCAAACTTCAGCGTAGCGGTTAACAGGCTGGTCGCAACCAG  >  W3110S.gb/4110436‑4110500

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑