Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4179988	4180001	14	16 [0]	[0] 17	gspF	general secretory pathway component, cryptic

ATGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATG  >  W3110S.gb/4179941‑4179987                                               | atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:1113987/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:1187407/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:1270420/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:1504906/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:1765556/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:1782305/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:2210203/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:2463100/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:252624/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:408564/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:684717/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:762384/47‑1 (MQ=255) atGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:985269/47‑1 (MQ=255)      gggCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:2891085/42‑1 (MQ=255)          cGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:2916011/38‑1 (MQ=255)            gTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATg  <  1:794648/36‑1 (MQ=255)                                               | ATGTCGGGCCGGTACGTTGCAACGTGTCGCTCAGACCTAAAAGAATG  >  W3110S.gb/4179941‑4179987

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑