Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4321684	4321685	2	13 [0]	[0] 11	phnM	carbon‑phosphorus lyase complex subunit

CCAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCA  >  W3110S.gb/4321619‑4321683                                                                 | ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:1149269/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:1181749/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:1390282/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:1390518/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:1522185/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:2067079/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:2459200/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:2607033/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:2787578/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:917612/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:970993/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGGGGGCa  >  1:3031062/1‑65 (MQ=255) ccAGTACGGTGGTGATGCCGCTAGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCa  >  1:2666250/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CCAGTACGGTGGTGATGCCGCTCGCCACCATCAGCGCGTCGTGGCTGCTCATCGCCGAGTGGGCA  >  W3110S.gb/4321619‑4321683

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑