Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4548663	4548665	3	12 [0]	[0] 5	fimI	fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis

GTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCA  >  W3110S.gb/4548598‑4548662                                                                 | gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  <  1:110504/65‑1 (MQ=255) gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  <  1:1134056/65‑1 (MQ=255) gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  >  1:1252872/1‑65 (MQ=255) gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  <  1:2179281/65‑1 (MQ=255) gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  <  1:2303925/65‑1 (MQ=255) gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  <  1:2631792/65‑1 (MQ=255) gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  >  1:2639893/1‑65 (MQ=255) gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  <  1:2872731/65‑1 (MQ=255) gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  <  1:2879350/65‑1 (MQ=255) gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  <  1:2947808/65‑1 (MQ=255) gTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCa  <  1:581751/65‑1 (MQ=255)                           cACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGTAATGTAGCa  <  1:930426/39‑1 (MQ=255)                                                                 | GTTTCATGCGGTTGGGGAAGATAGCGCACCGGTGCCTTTTGTTATTCATTTACGGGAATGTAGCA  >  W3110S.gb/4548598‑4548662

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑